HAb18G/CD147晶体结构—免疫球蛋白超家族新二聚化模式的发现

HAb18G/CD147晶体结构—免疫球蛋白超家族新二聚化模式的发现

论文摘要

目的CD147 (EMMPRIN、Basign、HAb18G)是一个I型整合跨膜糖蛋白,属于免疫球蛋白超家族(IgSF)成员。在体内大量涉及分子间相互作用的生理和病理过程,CD147均起着至关重要的作用。HAb18G/CD147是用抗人肝癌单克隆抗体(mAb)HAb18筛选人肝癌细胞cDNA文库而获得的一个新的肝癌相关抗原,具有刺激肝癌细胞和间质成纤维细胞分泌高水平基质金属蛋白酶(Matrix Metalloproteinases, MMPs)的功能,从而在肝癌浸润、转移过程中扮演重要角色。我们以前的研究表明,HAb18G/CD147不仅参与肿瘤侵袭、病毒感染以及内风湿关节炎发病机理,而且可做为一个新的通用型肿瘤生物标志物用于多种类型肿瘤的诊断和预后评估,因而成为相关疾病治疗干预措施的潜在靶标。尽管大量的研究揭示了CD147分子的多种生物学功能,但决定这些功能的结构基础仍是未解之谜,这不仅限制了对其功能机制的深入理解和进一步研究,也阻碍了针对这一抗原的新的抗体和小分子化合物的设计。因此,确定HAb18G/CD147分子的三维空间结构具有重要的科学意义和应用价值。本课题的研究目的是:通过高效的真核和原核表达体系,获得高纯度蛋白用于蛋白质结晶研究,利用X射线晶体衍射分析测定HAb18G/CD147分子的三维空间结构;在此基础上,通过计算机模拟分子对接,找到针对HAb18G/CD147分子的特异性单抗HAb18在该分子上的表位,并通过定点突变研究验证关键表位残基对抗原抗体识别和亲和力的影响。方法1 HAb18G/CD147胞外区(HAb18GEP)的高效表达和纯化1.1 HAb18GEP的定点整合真核分泌表达PcDNA5/FRT/18GEP-Fc重组表达质粒转染Flp-InTM CHO细胞并以潮霉素B筛选稳定高表达细胞株。用生物反应器大规模培养高表达CHO细胞株,收获的培养上清首先利用融合标签进行亲和层析纯化,再用3C蛋白酶特异性切除融合标签并再纯化。1.2 HAb18GEP的原核可溶性表达表达质粒pET21a(+)/HAb18GEP转化E.coli OrigamiB(DE3)菌株;表达产物用阴离子交换层析和凝胶过滤层析纯化。2 HAb18GEP的结晶和结构解析2.1 HAb18GEP的结晶和初步X-ray衍射采用悬滴扩散法对真核和原核表达的HAb18G/CD147胞外区蛋白进行晶体生长条件的筛选和优化,然后在X-ray衍射仪上进行天然和硒代蛋白晶体的初步衍射。2.2数据收集和结构解析在同步辐射光源(Photon Factory, Japan)上分别收集天然蛋白晶体和硒代蛋白晶体衍射数据,用单波长反常散射法(SAD)进行结构解析。首先用硒代蛋白晶体的衍射数据获得相位信息和初始结构模型,再用天然蛋白晶体的衍射数据进行结构确定和精修。3 HAb18单抗分子对接和突变验证利用计算机模拟HAb18单抗的三维结构并与HAb18G/CD147的晶体结构进行分子对接,分析特异性单抗HAb18的可能表位并通过定点突变实验进行验证。结果1 HAb18G/CD147胞外区(HAb18GEP)的高效表达和纯化1.1 HAb18GEP的定点整合真核分泌表达PcDNA5/FRT/18GEP-Fc重组表达质粒转染Flp-InTM CHO细胞并以潮霉素B筛选阳性细胞克隆,获得高表达细胞株H8F8E10。经生物反应器大规模培养后,培养上清中的表达产物可达到17mg/L。表达产物经亲和层析纯化并切除融合标签后,获得高纯度的真核HAb18G/CD147胞外区蛋白用于晶体培养。1.2 HAb18GEP的原核可溶性表达HAb18GEP在OrigamiB(DE3)菌株中以可溶形式表达;表达产物经阴离子交换层析和凝胶过滤层析纯化后,得到高纯度的原核可溶性蛋白用于晶体培养。2 HAb18GEP的结晶和结构解析2.1 HAb18GEP的结晶和初步X-ray衍射经过晶体生长条件的大量筛选和优化,原核表达的HAb18GEP在适宜条件下培养出蛋白单晶;在此基础上,制备硒代蛋白并培养出硒代蛋白晶体,通过在X-ray衍射仪上的初步衍射,筛选出分辨率在2.8~3.0?的天然和硒代蛋白晶体用于同步辐射光源上的数据收集。2.2数据收集和结构解析利用天然蛋白晶体的衍射数据(2.8?)和硒代蛋白晶体衍射数据(3.1?)进行结构解析的结果,确定HAb18G/CD147胞外区晶体的空间群为P41212,在一个不对称单元有四个分子,每个分子由两个Ig样结构域组成,N端结构域为Ig C2型,C端结构域为Ig I型;四个分子相互粘联形成寡聚体。3 HAb18单抗分子对接和突变验证抗原抗体分子对接的结果显示:HAb18G/CD147胞外区残基Glu49、Thr51、Asp65为HAb18单抗的关键表位残基。突变前后的Western Blot显示,突变后的抗原结合抗体的能力明显下降。结论1. HAb18G/CD147分子晶体结构的解析,首次从原子水平揭示了一个具有独特的IgC2–I结构域排列方式的IgSF成员,并认为它可能代表了其它CD147家族成员的一般结构。2.在晶体结构中发现的由IgC2结构域介导的二聚化模式为IgSF的同型粘附模式增添了新的范例。3.首次通过晶体结构观察到CD147分子的寡聚现象,从而为该分子寡聚依赖的重要生物学功能提供了结构的阐释。4.基于HAb18G/CD147抗原的晶体结构,首次通过计算机模拟分子对接和定点突变研究证实HAb18G/CD147胞外区残基Glu49、Thr51、Asp65为单抗HAb18的关键表位残基。

论文目录

  • 缩略语表
  • 中文摘要
  • Abstract
  • 前言
  • 文献回顾
  • 1 CD147 分子的研究进展
  • 2 肝癌相关抗原HAb18G/CD147 的研究进展
  • 3 细胞黏附分子(CAM)的三维结构研究进展
  • 正文
  • 实验一 HAb18G/CD147 胞外区的高效表达和纯化
  • 1 材料
  • 1.1 主要仪器
  • 1.2 主要试剂
  • 1.3 主要缓冲液
  • 1.4 载体和细胞株
  • 2 方法
  • 2.1 HAb18GEP 的真核表达
  • 2.2 HAb18GEP 的原核表达
  • 3 结果
  • 3.1 HAb18GEP 的真核表达
  • 3.2 HAb18GEP 的原核表达
  • 4 讨论
  • 实验二 HAb18G/CD147 胞外区晶体结构解析
  • 1 材料
  • 1.1 主要仪器
  • 1.2 主要试剂
  • 2 方法
  • 2.1 HAb18GEP 蛋白晶体培养
  • 2.2 HAb18GEP 晶体的初步X 线衍射、数据收集与处理
  • 2.3 HAb18GEP 蛋白晶体结构解析
  • 2.4 HAb18GEP 在溶液中的寡聚状态分析
  • 2.5 分子动力学模拟
  • 2.6 MAb HAb18 的分子对接和突变验证
  • 3 结果
  • 3.1 HAb18GEP 蛋白晶体培养
  • 3.2 HAb18GEP 晶体的初步X 线衍射、数据收集与处理
  • 3.3 HAb18GEP 晶体结构解析
  • 3.4 HAb18GEP 在溶液中的寡聚状态分析
  • 3.5 分子动力学模拟
  • 3.6 MAb HAb18 的分子对接和突变验证
  • 4 讨论
  • 小结
  • 参考文献
  • 个人简历和研究成果
  • 致谢
  • 相关论文文献

    • [1].HAb18G/CD147在食管鳞状细胞癌中的表达及其临床意义[J]. 细胞与分子免疫学杂志 2011(07)
    • [2].新型标志物HAb18G/CD147在大样本胃癌组织中的表达研究[J]. 诊断学理论与实践 2012(01)
    • [3].红景天对大鼠肝纤维化肝脏中HAb18G/CD147的表达[J]. 黑龙江医药科学 2016(02)
    • [4].大黄酸和红景天对肝纤维化大鼠α-SMA、Hab18G/CD147表达的影响[J]. 黑龙江医药科学 2020(04)
    • [5].HAb18G/CD147的表达与卵巢上皮性恶性肿瘤侵袭转移及意义的研究进展[J]. 实用妇产科杂志 2013(12)
    • [6].HAb18G/CD147胞外近膜区与integrin β1亚基MIDAS位点结合调节肝癌细胞恶性表型[J]. 医学争鸣 2012(04)
    • [7].肝癌细胞内HAb18G/CD147信号转导通路关键分子的筛选[J]. 细胞与分子免疫学杂志 2017(09)
    • [8].CCL_4腹腔注射和胆总管结扎致大鼠肝损伤对比的实验性研究[J]. 广东化工 2020(17)

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