论文摘要
为了探讨生长分化因子9(GDF9)基因与小尾寒羊高繁殖力之间的关系,为小尾寒羊高繁殖性状的辅助选择提供有效的分子标记,采用PCR-SSCP方法,对小尾寒羊、白萨福克羊、特克赛尔羊和藏羊中GDF9基因的单核苷酸多态性进行研究。结果表明:在小尾寒羊、白萨福克羊和特克赛尔羊中检测到AA、AB、BB三种基因型,在藏羊中检测到了AA、AB两种基因型。四个绵羊品种A等位基因频率分别为64.1%、73.3%、73.35%、81.65%,B等位基因频率分别为35.9%、26.7%、26.65%、18.35%。测序结果表明,BB型与AA型相比发生了一处单碱基突变;与GeneBank上GDF9基因(登录号:AF078545)序列比较发现AA型与原序列完全相同,定义为野生型,BB型在外显子2的75位发生了C→T的单碱基突变,定义为突变型。翻译成氨基酸序列比较发现突变没有引起氨基酸的改变,为沉默突变。小尾寒羊和藏羊品种之间基因型分布差异显著(P<0.05),其它各品种之间基因型分布差异均不显著(P>0.05)。经X2适合性检验,4个绵羊品种中X2值均未达到显著水平,此扩增片段均处于Hardy-Weinberg平衡状态。这说明GDF9基因G2突变这对引物扩增片段不受选育措施的影响,在选育过程中它们的遗传仍然是随机的。不同基因型和小尾寒羊产羔数最小二乘方差分析表明,小尾寒羊产羔数的最小二乘均值关系为AB>AA>BB,但3种基因型间差异不显著(P>0.05)。GDF9基因的G2突变对小尾寒羊高繁殖力没有显著影响。
论文目录
摘要Summary第一部分 文献综述1 小尾寒羊的研究概况2 多羔基因研究概况2.1 已知突变的多羔主效基因2.2 已知遗传模式的主效基因2.3 推定多羔主效基因3 GDF9 基因研究进展3.1 生长分化因子9 的结构、功能及调控3.2 生长分化因子9 基因研究进展4 SSCP 技术研究4.1 SSCP 的建立与发展4.2 PCR-SSCP 方法的原理4.3 PCR-SSCP 的特点4.4 PCR-SSCP 方法的应用5 研究的目的和意义第二部分 材料与方法1 实验材料1.1 实验样本的来源及采集方法1.2 主要仪器设备1.3 主要试剂1.4 分析工具软件1.5 主要药品及试剂的制配1.6 PCR 扩增所用的引物2 实验方法2.1 实验样品DNA 的提取2.2 绵羊GDF9 基因的PCR-SSCP 分析2.3 统计方法第三部分 结果与分析1 绵羊GDF9 基因PCR 产物扩增结果2 GDF9 基因SSCP 条件优化结果2.1 凝胶浓度及组分的优化2.2 电泳条件2.3 GDF9 基因外显子的4 对引物PCR 产物的SSCP 结果2.4 不同基因型个体的测序2.5 氨基酸序列同源性比较3 群体遗传学分析3.1 GDF9 基因频率及基因型频率3.2 Hardy-Weinberg 平衡状态的检验3.3 不同绵羊品种GDF9 基因型分布独立性检验3.4 GDF9 基因的杂合度、有效等位基因数和多态信息含量3.5 GDF9 基因多态性与小尾寒羊高繁殖性状的相关分析第四部分 讨论1 实验材料的选择2 侯选基因的确定3 影响PCR 过程的因素3.1 PCR 模板DNA 的质量3.2 PCR 反应条件的影响因素4 SSCP 检出率的影响因素4.1 PCR 片段的长度4.2 非变性聚丙烯酰胺凝胶成分4.3 上样缓冲液与变性4.4 电泳条件5 SSCP 结果的分型6 SSCP 检测结果和基因测序结果分析7 SSCP 检测结果对小尾寒羊产羔数影响的分析第五部分 结论致谢参考文献作者简介导师简介
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标签:小尾寒羊论文; 生长分化因子基因论文; 单链构象多态性论文; 高繁殖力论文;