论文摘要
本研究利用mtDNh分子标记技术对我国引进的羊驼这一物种进行了系统发育的探讨,利用RAPD标记技术对羊驼种群内亲缘关系进行了研究。 应用mtDNA分子标记技术,对羊驼Cytb基因部分序列进行扩增,并随机抽取两样本测序,测序结果均为360bp大小的片段,没有发现突变位点,提示mtDNh Cyt b基因具有较强的保守性。将测定后的序列提交GeneBank,登录号为AY839860。并与驼科其它物种的mtDNA Cyt b基因进行同源序列比较,各物种间序列的变异位点基本是转换多于颠换,Cyt b基因序列中碱基替换大都发生在密码子第3位点,第2位点最少。用NJ法和MP法对7个物种的mtDNA Cyt b基因序列进行聚类,从聚类结果可以看出,两种方法得出的树状图基本相同,羊驼与原驼形成的姊妹群分化较晚,而骆马是较美洲驼、原驼和羊驼分化早的类群,并推测出旧世纪驼属中种的形成大约发生在4百万年前。将驼科动物mtDNh Cyt b基因序列与部分哺乳动物的mtDNh Cyt b基因进行同源序列比较,用NJ法和ML法构建进化树,结果显示:驼科动物与猪科(猪)、马科(马和驴)亲缘关系较近。 应用RAPD技术对羊驼群体进行亲缘关系检测。在所采用的40条随机引物中筛选出10条,优化了RAPD的反应条件,确立了适合于羊驼基因组RAPD分析的最佳反应体系和反应程序。计算出个体间之间的带纹相似系数及遗传距离指数,带纹相似系数位于0.3901~0.7851之间,平均为0.5374;彼此间的遗传距离:最小为0.2149,最大为0.6099,平均为0.4626,并绘制出个体间亲缘关系树状聚类图,结果显示羊驼种群内遗传基础广泛,证明其个体间的血缘关系较远,这将有利于羊驼种群的正常生长、发育、繁殖和快速扩群。
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