两种探针DNA指纹图对小鼠遗传检测的比较研究

两种探针DNA指纹图对小鼠遗传检测的比较研究

论文摘要

目的:探讨用人工合成的两种非放射性标记的寡聚核苷酸探针制作的DNA指纹图在近交系小鼠遗传检测中的应用,并通过比较,分析两种探针的可靠性和稳定性。为进一步完善DNA指纹技术,使其得到更加广泛的发展,并为近交系小鼠遗传检测方法的改进、建立标准的实验小鼠DNA指纹数据库用于不同地区实验室间的使用和参考提供重要信息。方法:采用人工合成的两种生物素标记的探针(GGAT)4、(GTG)5以及Southern杂交的方法制作BALB/c、C57BL/6J、DBA/2、C3H近交系小鼠的DNA指纹图,对这4个品系的小鼠进行遗传检测。通过分析品系内小鼠和不同品系小鼠DNA指纹图的平均图带数、图带大小、平均相似系数((?))、平均等位基因频率((?))、各品系的品系特异性带数(S)及在不同探针下所占百分比(S/T)、相同DNA指纹图的概率(P)等,比较两种探针的重复性和优越性。结果:在所检测的4个近交系小鼠的品系中,两种探针都表现出品系内个体DNA指纹图谱的带型基本一致,不同品系间带型差别明显。用不同的探针得到的指纹图是完全不一样的。两种探针对BALB/c、C57BL/6J、DBA/2、C3H 4种近交系小鼠产生的DNA指纹图的平均图带数均为8~12条,且大部分分布在2kb以上,具有良好的多态性。品系内平均DNA指纹图相似系数在0.92~1.00的范围内,具有相同指纹图的概率均在3.1×10-1以上,极显著地高于品系间的相似系数和相同指纹图的概率((?)=0.22~0.39,P<1.07×10-4)。另外,(GTG)5探针得到的品系特异性带数百分比略高于(GGAT)4探针。结论:用非放射性标记的人工合成的寡聚核苷酸探针(GCAT)4以及(GTG)5所得到的DNA指纹图遗传变异灵敏度高,稳定性好,探针来源容易,杂交时间短,操作简便,并可检测出个体或品系间的遗传距离,同时非放射性标记技术可避免放射性同位素的污染。试验还发现(GTG)5探针的重复性和稳定性比(GGAT)4探针较好,并且用两种不同的探针进行DNA指纹分析,可以检出基因组中更多的个体特异性信息,结果更加可靠。因此这两种探针在近交系小鼠的遗传质量检测中有广阔的应用前景,并可推广到其他实验动物的遗传检测及临床医学和法医学的应用中。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 1.近交系小鼠
  • 2.近交系小鼠的遗传检测
  • 3.DNA指纹技术
  • 4.指纹技术中的探针
  • 材料和方法
  • 1.实验材料
  • 2.实验方法
  • 结果
  • 1.寡聚核苷酸探针产生的小鼠DNA指纹图
  • 2.品系内指纹图的变异性
  • 3.品系间的变异性
  • 4.两种探针的特异性与稳定性
  • 讨论
  • 1.指纹图的基本原理——DNA多态性
  • 2.寡聚核苷酸探针及非放射性标记的应用
  • 3.BALB/c、C57BL/6J、DBA/2、C3H近交系小鼠
  • 4.DNA指纹图存在的问题及发展方向
  • 结论
  • 参考文献
  • 攻读学位期间发表的学术论文目录
  • 附录
  • 1.缩写词表
  • 2.实验动物合格证
  • 致谢
  • 相关论文文献

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