新疆部分人群SEN病毒的感染状况及亚型分析

新疆部分人群SEN病毒的感染状况及亚型分析

论文摘要

目的:1.建立聚合酶链式反应(PCR)筛查SENV的反应体系和流程;2.检测SENV-D和SENV-H在新疆地区部分人群中的流行情况;3.对SENV-D和H亚型进行进化地位分析。方法:1.对象:选取98例健康供血员作为对照组,113例HBV阳性、57例抗-HCV阳性、27例ALT升高者作为病例组;2.用Ready PCR血清病毒DNA纯化系统提取样本血浆中的病毒DNA,针对SENV ORF1部分区域设计、合成引物,采用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增SENV-D和SENV-H亚型;3.运用SPSS10.0进行数据分析;用DNASTAR软件分析SENV的系统进化情况。结果:1.建立的巢式聚合酶链式反应(nPCR)具有较高的特异性和重复性;2. SENV在对照组、HBV阳性组、抗-HCV阳性组、ALT升高组检出率分别为35.7%、51.3%、36.8%和14.8%,其中HBV阳性组的检出率与对照组有显著差异(P <0.05);3. SENV在汉族、维吾尔族和回族中的检出率分别为41.9%、38.9%和15.8%;4.系统进化树分析,SENV-D和H亚型在进化过程中无地域差别。结论:1.建立了同时检测SEN病毒D和H型的巢式聚合酶链检测方法(nPCR);2.获得了3个SENV D型片段和2个SENV H型片段;3.在新疆汉族、维吾尔族和回族中都存在SENV D和H亚型感染;4. SENV与HBV有相似的传播途径,但可能更多依赖非输血传播;5.系统发育分析显示新疆分离株(SENV-D-XJ6、XJ-58和XJ-111以及SENV-H-X-J5和XJ-172)分别与己发表的SENV-D(AB059352)和SENV-H(AB059353)日本分离株同属一个亚型;新疆分离株属于TTV超家族。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 英文缩略词表
  • 前言
  • 材料与方法
  • 1 材料
  • 2 方法
  • 结果
  • 1. PCR 扩增产物电泳结果
  • 2. PCR 扩增产物的测序
  • 3. 测序结果与GenBank 主要分离株之间的同源性分析
  • 4. 巢式PCR 方法重复性的评定
  • 5. SENV D 和H 型在健康供血员、HBV 和抗-HCV 阳性及ALT 升高中的检出状况
  • 6. SENV D 型及H 型在汉族、维吾尔族、回族中的检出状况
  • 7. 健康供血员SENV 感染的年龄、性别及献血次数的分布
  • 8. SENV D 亚型核苷酸序列分析
  • 9. SENV H 亚型序列核苷酸同源性分析
  • 10. SEN病毒,TTV原型株和变异株的进化树分析
  • 11. 不同地域SENV D亚型分离株进化关系分析
  • 12. 不同地域SENV H 亚型分离株进化关系分析
  • 讨论
  • 1. SEN 病毒检测方法
  • 2. 新疆部分人群SEN 病毒检出状况
  • 3. SEN 病毒系统进化分析
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录1
  • 附录2
  • 附录3
  • 附录4
  • 文献综述
  • 致谢
  • 作者简介
  • 石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  

    新疆部分人群SEN病毒的感染状况及亚型分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢