广西猪萎缩性鼻炎流行病学调查及猪多杀性巴氏杆菌OMPH基因的克隆与序列分析

广西猪萎缩性鼻炎流行病学调查及猪多杀性巴氏杆菌OMPH基因的克隆与序列分析

论文摘要

本试验根据Bb的Flagellin gene基因和T+Pm的toxA基因分别设计了一对特异性引物(B1/B2和TOXA2/TOXA3),以构建AR多重PCR检测体系。结果显示该多重PCR具有非常高的特异性和敏感性。利用构建的多重PCR方法对广西10个县市猪场采来的353份鼻拭子进行检测,结果T+Pm PCR阳性数为110份,Bb PCR阳性数为59份。T+Pm和Bb不但从表现AR临床症状的猪体内检出,而且在不表现任何临床症状的猪体内也分离出该病原体,数据表明广西猪场感染T+Pm和Bb的情况十分普遍,且以局部地区爆发(崇左、玉林、陆川)和极大部分地区隐性感染为主。AR在广西范围内的分布情况:桂东南(贵港、玉林、陆川、博白)、南宁及周边县市(武鸣、扶绥、崇左)、桂北(柳州)、桂南(合浦)AR感染情况都比较严重,调查结果有助于猪场尽快采取措施净化AR。由此可见建立AR的T+Pm和Bb的多重PCR方法对广西进行流行病学调查,是非常必要的,对广西养猪业的发展具有重大的意义。OMPH是多杀性巴氏杆菌的主要外膜蛋白,OMPH在致病菌对宿主的感染和致病过程中起着重要的作用。试验另外设计引物OMPH3/OMPH4,成功地对广西8株Pm的OMPH基因进行了PCR扩增、克隆和测序。取其中OMPH基因的ORF核苷酸序列并推导其氨基酸序列,与GeneBank上公开发表的其它OMPH基因序列进行同源性比较和遗传进化树分析,结果显示:这8株广西Pm的OMPH基因可分为2个群:Ⅰ群和Ⅱ群,Ⅰ群包括:GXHP、GXCZ、GXLZ、GXFS、GXWM,GXNN,GXGG,GXYL单独为Ⅱ群。氨基酸残基中Ⅱ群的特异性变化位点有第45、46、82、83、85、91、101、182、188、218、223、258、272、322、324、326位。8株OMPH基因编码区核苷酸及推导的氨基酸序列同源性的比较结果都分别在90.9-100%之间,具有很高的同源性。通过分析结果以了解广西Pm的OMPH基因与其它毒株在遗传特点、进化规律上的关系,研究OMPH应用于疫苗的可行性,为研制更为有效的适合广西的新型疫苗打下良好的基础。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 目录
  • 第一章 文献综述
  • 第二章 实验研究
  • 1.材料与方法
  • 1.1材料
  • 1.2方法
  • 实验一:二重PCR检测方法的构建与广西AR流行病学调查
  • 1.2.1 PCR菌体模板的制备 (DNA抽提)
  • 1.2.2 各病原菌的单重PCR扩增
  • 1.2.3 二重PCR扩增
  • 1.2.4 电泳
  • 1.2.5 广西AR流行病学调查
  • 实验二:多杀性巴氏杆菌OMPH基因的克隆与序列分析
  • 1.2.6 阳性病料的鉴定
  • 1.2.7 菌株来源
  • 1.2.5 OMPH基因的扩增
  • 1.2.9 电泳
  • 1.2.10 PCR产物胶回收
  • 1.2.11 感受态细胞的制备
  • 1.2.12 基因克隆
  • 1.2.13 基因测序
  • 1.2.14 序列比较
  • 1.2.15 遗传演化分析
  • 2.结果
  • 2.1 单重PCR检测方法的建立
  • 2.2 二重PCR检测方法的建立
  • 2.3 广西AR流行病学调查结果
  • 2.4 阳性病料的鉴定结果
  • 2.5 病料来源结果
  • 2.6 OMPH基因的扩增结果
  • 2.7 重组质粒的酶切鉴定结果
  • 2.8 核普酸序列测定结果
  • 讨论
  • 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录
  • 相关论文文献

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