5个绵羊群体FecB基因的连锁微卫星研究

5个绵羊群体FecB基因的连锁微卫星研究

论文摘要

采集小尾寒羊血样48份,湖羊、藏羊、无角陶赛特羊、陶塞特♂×小尾寒羊♀F1代杂种羊各25份,采用微卫星标记法,选择FecB基因紧密连锁的6个微卫星基因座LSCV043、GC101、471U、Bulge5、BMS2508和300U共6个微卫星座位,通过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳对其微卫星多态性进行了研究,并选择了三个微卫星座位LSCV043、BMS2508和300U对32只有产羔记录的小尾寒羊进行了关于产羔数的研究,旨在探讨FecB基因紧密连锁的6个微卫星基因座在5个绵羊群体中的多态性和对小尾寒羊多羔性状分子标记辅助选择提供理论依据。结果表明:对5个群体148只个体血液DNA样品的PCR产物进行了非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳以及电泳图谱分析,结果共检测到54个等位基因; 6个微卫星座位在5个绵羊群体中的等位基因数分别为22、4、3、8、23。微卫星座位LSCV043、BMS2508、300U和Bulge5属于高度多态基因座,GC101和471U属于中度多态基因座。小尾寒羊、藏羊、湖羊、陶赛特羊、陶寒杂种羊的平均PIC、Ne、H和分别为0.680/5.60/0.736、0.561/3.21/0.647、0.621/4.21/0.699、0.606/3.88/0.693、0.661/4.89/0.728。6个微卫星座位在小尾寒羊中遗传变异最大,在藏羊中的遗传变异最小。5个绵羊群体间的DA遗传距离在0.1995~0.3461之间,其中小尾寒羊与陶寒杂种羊的遗传距离最小,其次是小尾寒羊与湖羊的遗传距离(0.2027);而小尾寒羊与陶赛特羊的遗传距离最大。5个绵羊群体间的DS标准遗传距离在0.0547~0.3272之间,其中陶寒种羊的遗传距离最小,小尾寒羊与陶赛特的遗传距离最大。基于DA距离和DS标准遗传距离构建的系统聚类图略有不同。微卫星座位LSCV043的基因型139/115bp、BMS2508的基因型178/166bp、300U的基因型172/156bp在所研究的32只小尾寒羊群体中对应的最小二乘平均值最高,分别为3.67、4.00、4.00只。

论文目录

  • 摘要
  • Summary
  • 第一部分 文献综述
  • 1 微卫星DNA
  • 1.1 微卫星 DNA 的概念及特征
  • 1.2 微卫星 DNA 的检测方法
  • 1.3 微卫星 DNA 的应用
  • 1.4 微卫星 DNA 方法的局限性和不足
  • 2 绵羊繁殖性状后选基因
  • 2.1 FecB 基因
  • 2.2 FecX 基因
  • 2.3 BMP15 和GDF9 基因
  • 2.4 BMP 与绵羊多胎机理
  • 第二部分 试验部分
  • 1 前言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.2 仪器设备
  • 2.3 化学药品及试剂的配制
  • 2.4 基因组 DNA 的提取
  • 2.5 PCR 扩增
  • 2.6 统计方法
  • 第三部分 结果与分析
  • 3.1 PCR 扩增产物琼脂糖电泳图和非变性聚丙烯酰胺电泳图
  • 3.2 微卫星多态位点的等位基因及其频率
  • 3.3 杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)
  • 3.4 各品种(群体)间的遗传距离
  • 3.5 系统发育树的构建
  • 3.6 LSCV043,BMS2508,300U 的不同基因型与小尾寒羊产羔数的关系
  • 第四部分 讨论
  • 4.1 5 个绵羊群体的遗传多态性
  • 4.2 5 个绵羊群体的遗传距离和系统聚类
  • 4.3 微卫星座位的选择和小尾寒羊产羔数
  • 4.4 样本的数量
  • 4.5 关于聚丙烯酰胺凝胶电泳及带型的判别
  • 第五部分 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 导师简介
  • 相关论文文献

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