我国近海精致真刺水蚤（Euchaeta concinna）和中华哲水蚤（Calanus sinicus）遗传多样性的研究

论文摘要

海洋桡足类是海洋浮游动物的重要组成部分,种类多、数量大、分布广。由于我国海洋地理区域差异较大,各海区地理环境、生态条件不尽相同,不同地区浮游动物群落面貌和特征有所不同。其共有种在适应外界不同环境和自然选择以及遗传漂移过程中可能发生遗传分化。本文采用mtDNA COⅠ基因片断序列分析对我国几个海域中华哲水蚤的遗传多样性进行了比较研究,并利用ISSR分子标记技术对东海精致真刺水蚤进行了遗传多样性初步分析。DNA序列分析是目前检测DNA水平多态性非常有用的技术。线粒体DNA(mtDNA)序列具有进化较快和不重组特点,这使其成为遗传分化检测的强有力工具。本文对采自中国渤海黄河口水域(BY)、北黄海近岸(YN)、南黄海近岸(YS)、东海近岸(DN)、东海沙埕港(ES)和南海大亚湾(SD)中华哲水蚤个体基因组DNA进行mtCOI序列扩增测序,并结合实验室已有包括以上海域及青岛近岸水域的中华哲序列进行分析,研究中国近岸几个海域中华哲水蚤的遗传多样性与遗传分化。结果显示在扩增的239个中华哲水蚤个体中共检测到了48个多态性核苷酸位点,39种单倍型(haplotype),其碱基组成A、C、G、T平均含量分别为23.5%、19.6%、22.7%和34.2%。平均遗传距离揭示七个海域中华哲水蚤的遗传分化很低,东海群体与其他群体的差异稍高。本文采用ISSR分子标记技术对东海精致真刺水蚤三个站位群体遗传多样性与种群遗传结构进行了研究,筛选出7条多态位点较丰富的ISSR引物。结果显示三个群体之间总体遗传相似性较高而遗传分化较小,而地理上距离较远的1004群体与609群体遗传距离也较大,可能存在一定程度的分化。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 前言
• 1.1 海洋浮游动物的研究历史
• 1.2 遗传标记技术的发展
• 1.2.1 形态学标记
• 1.2.2 细胞学标记
• 1.2.3 生物化学标记
• 1.2.4 DNA 分子水平标记
• 1.3 遗传标记在桡足类研究中的应用
• 1.3.1 细胞学标记
• 1.3.2 生物化学标记
• 1.3.3 DNA 分子水平标记
• 1.4 结语
• 2 中华哲水蚤不同地理种群遗传多样性的比较分析 引言
• 2.1 引言
• 2.2 材料与方法
• 2.2.1 材料
• 2.2.2 主要仪器设备
• 2.2.3 主要试剂及溶液配制
• 2.2.4 实验方法
• 2.3 实验结果
• 2.3.1 基因组DNA 提取结果
• 2.3.2 PCR 产物检测
• 2.3.3 测序
• 2.3.4 中华哲水蚤mtDNA COI 基因扩增片段序列分析
• 2.4 讨论
• 3 东海精致真刺水蚤遗传变异的 ISSR 分析
• 3.1 引言
• 3.2 材料与方法
• 3.2.1 样品的采集与保存
• 3.2.2 主要仪器设备
• 3.2.3 主要试剂及溶液配制
• 3.2.4 实验方法
• 3.2.5 数据处理分析
• 3.3 实验结果
• 3.3.1 引物筛选
• 3.3.2 ISSR-PCR扩增结果
• 3.3.3 三个精致真刺水蚤群体的遗传多样性
• 3.4 讨论
• 3.4.1 ISSR 技术在海洋桡足类遗传多样性研究的优越性
• 3.4.2 三个精致真刺水蚤群体的遗传多样性
• 3.4.3 海流对三个群体的影响
• 参考文献
• 致谢
• 在学期间科研情况