兔GHR基因第10外显子多态性及其与部分生产性状的关联研究

论文摘要

本实验以比利时兔、天府黑兔、齐卡兔、哈白兔及加利福尼亚兔共220只肉兔为试验材料,采用单链构象多态性（PCR-SSCP）技术,研究了兔GHR基因第10外显子的SNPs及其与生产性能的相关性。结果如下:SCCP分析表明,在5个肉兔品种中引物1扩增片段都发现了A、B 2个等位基因,其频率分别为0.6386和0.3614,AA、AB、BB 3种基因型频率分别为0.4273、0.4227和0.15;引物2扩增片段都发现了M、N 2个等位基因,其频率分别为0.6227和0.3773,MM、MN、NN 3种基因型频率分别为0.4364、0.3727和0.1909。进一步测序表明,引物1扩增片段多态性位点由705bp处T→C突变造成,引物2扩增片段多态性位点由810bp处C→T突变造成。2个位点都属于中度多态,PIC分别为0.3471和0.3205。不同肉兔品种生产性状最小二乘分析表明,品种效应对于活重、全净膛、屠宰率、熟肉率、料肉比等生产性状影响很大,其中天府黑兔的活重、全净膛、屠宰率的最小二乘均值显著高于其它4个品种;哈白兔的熟肉率的最小二乘均值显著高于比利时兔;对于料肉比而言,哈白兔最小二乘均值显著低于齐卡兔,与其他三个品种差异不显著。基因型与生产性状的相关性分析表明,705 SNP位点中基因型AA的活重、全净膛、屠宰率、熟肉率最小二乘均值都显著高于基因型BB（P＜0.05）;810 SNP位点中基因型MM的活重、全净膛、屠宰率、熟肉率最小二乘均值都显著高于基因NN（P＜0.05）。705 SNP和810 SNP两位点9种基因型组合的料肉比、屠宰率最小二乘均值差异均不显著;基因型组合ABNN的活重最小二乘均值都显著高于基因型组合AANN、BBMM（P＜0.05）;基因型组合AAMM、ABNN、BBMN的全净膛最小二乘均值与基因型组合BBMM差异显著（P＜0.05）,而与其它基因型组合最小二乘均值差异不显著;基因型组合AANN、ABMM、BBMN的熟肉率最小二乘均值都显著高于基因型组合BBMM（P＜0.05）。因此可考虑将GHR基因外显子10可作为影响兔部分生产性状的候选基因。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 文献综述
• 1.1 动物的生长机理
• 1.2 生长激素受体（GHR）的作用
• 1.3 生长激素受体的调节
• 1.3.1 GHR的个体发育差异
• 1.3.2 营养状况对GHR的影响
• 1.3.3 内分泌因子对GHR的调节
• 1.4 GHR的结构及其介导的信号转导途径
• 1.4.1 GHR的结构
• 1.4.2 GHR的信号转导途径
• 1.5 GHR功能结构分区（突变分析）
• 1.5.1 GH激活Jak2的结构基础
• 1.5.2 参与调控基因表达的GHR结构域
• 1.5.3 参与代谢调控途径的GHR结构域
• 1.5.4 参与内部化的区域
• 1.5.5 受体Tyr磷酸化作用的重要性
• 1.6 GHR在不同物种上的研究进展
• 1.6.1 鸡
• 1.6.2 猪
• 1.6.3 牛
• 1.6.4 羊
• 1.7 SSCP技术的研究概况
• 1.7.1 SSCP的建立与发展
• 1.7.2 PCR-SSCP方法的原理
• 1.7.3 PCR-SSCP的应用
• 1.7.4 SNP及其研究方法
• 1.8 本研究的目的与意义
• 2 材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 试验动物选择及数据采集
• 2.1.2 主要仪器设备
• 2.1.3 引物合成
• 2.1.4 主要试剂及配制
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 基因组DNA的提取
• 2.2.2 DNA浓度和纯度的检测
• 2.2.3 目的基因的扩增
• 2.2.4 PCR产物的检测
• 2.2.5 PCR扩增产物的SSCP分析及基因型判定
• 2.2.6 序列测定
• 2.3 数据分析
• 2.3.1 基因频率和基因型频率的计算
• 2.3.2 遗传多态性分析
• 2.3.3 Hardy-Weinberg平衡状态的检验
• 2.3.4 基因型与兔的生产性状的相关分析
• 3 试验结果
• 3.1 模板DNA抽提和PCR扩增结果
• 3.1.1 模板DNA的抽提结果
• 3.1.2 兔GHR基因外显子10的PCR扩增结果
• 3.1.3 PCR-SSCP多态性检测结果
• 3.1.4 GHR基因外显子10部分序列测序结果
• 3.2 基因的遗传特性分析
• 3.2.1 各品种2个基因座的基因频率和基因型频率分析
• 3.2.2 GHR基因外显子10的遗传纯合度、杂合度、多态信息含量分析
• 3.2.3 Hardy-Weinberg平衡的检验
• 3.3 兔GHR基因外显子10与生产性状的相关性分析
• 3.3.1 各基因型对生产性状的遗传效应分析
• 3.3.2 不同品种兔生产性状的比较分析
• 4 讨论
• 4.1 关于DNA抽提的优化
• 4.2 PCR反应体系与反应条件的优化
• 4.3 GHR基因外显子10多态性位点的遗传特性分析
• 4.4 基因型对生产性状的影响
• 4.5 品种对生产性状的影响
• 4.6 GHR基因的应用前景
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢