导读:本文包含了平衡几何构型论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:DNA凝聚,弹性细杆模型,界面张力,离子浓度
平衡几何构型论文文献综述
萧业[1]（2016）在《基于空间弹性细杆模型的DNA平衡几何构型与稳定性研究》一文中研究指出近年来,随着分子生物学的飞速发展,人们将越来越多的目光集中于生物大分子这一研究领域。而DNA作为一种典型的生物大分子,其所具备的储存和传递生命遗传信息的能力使得它逐渐成为了分子生物领域的一个研究热点。由于DNA几何构型的平衡与稳定直接影响着遗传信息的表达,因此,对于DNA平衡几何构型及其稳定性的研究是了解并应用DNA分子链的基础。自1953年Watson和Crick借助X射线晶体衍射技术推测出DNA的双螺旋结构以来,关于DNA分子链的理论基础研究不断取得突破。尽管对于DNA分子链的内部分子结构的探索属于量子力学的研究范畴,但其在生物细胞中的宏观几何构型与外力势能作用下的力学性能的研究可以借助于经典力学的弹性细杆模型来实现。由此产生了一个经典弹性力学与分子生物学相互交叉的新的研究领域。其在本质上采用连续介质力学的概念与思路研究曲杆的几何形态与变形,而在方法上又可运用非线性力学和分析力学对DNA分子链的平衡构型与稳定性进行分析。因此,本文在连续介质力学的基础上,通过建立空间弹性细杆模型,来模拟计算DNA分子链在溶液中的平衡几何构型,并对其外力作用下的弹性响应与几何构型的稳定性做了研究分析。本文的第一部分简要介绍了DNA弹性细杆的几何描述,概述了Kirchhoff弹性杆理论的基本假定与其适用的前提条件和物理意义,给出了弹性细杆的Kirchhoff平衡方程;阐述了物质的界面层与界面张力、界面自由能的概念,通过Young-Laplace方程推导出了固-液界面张力的表达式,将其引入Kirchhoff方程,并沿细杆截面周长对弧坐标进行积分得到了受界面牵引力作用的DNA分子链平衡控制方程。第二部分则基于固-液界面的吸附原理,通过Gibbs吸附方程与Langmuir吸附方程,建立起溶液浓度与固-液界面张力的关系,并推导出其具体表达式;与此同时,借助Poisson-Boltzmann理论将溶液浓度引入长分子链的熵弹性,得到了溶液浓度与DNA分子链弹性模量的直接关系式。将上述两式代入DNA弹性细杆的平衡控制方程,应用龙格-库塔数值算法模拟计算出以圆柱形螺旋线与椭圆柱形螺旋线为初始构型的DNA链段在不同溶度浓度中的凝聚构型,并对其进行了初步的分析。第叁部分针对DNA在外力载荷作用下的边界条件,将端部力与界面张力共同作用下的DNA链段的几何构型与弹性响应的研究归结为求解Kirchhoff微分方程组的边值问题,并选用打靶法给出在其不同端部力作用下的数值解,从而确定DNA链段的几何构型。同时,利用DNA链段两端在主轴坐标系中的坐标计算得到不同端部力对应的末端距数值,拟合出力-末端距曲线,并分析了不同溶液浓度对DNA链段的力-末端距曲线的影响。第四部分从分析力学的角度出发,通过Kirchhoff动力学比拟,将动力学的时间变量t置换为一维空间变量即弧坐标s,从而得到了基于弧坐标的哈密顿原理与Lagrange方程。并基于此推导出能量密度函数依赖于曲率、挠率及它们一阶导数的DNA螺旋线的Euler-Lagrange方程。第五部分则通过引入截面的扭转角及其一阶导数,将曲线的Euler-Lagrange方程推广至曲杆的Euler-Lagrange方程组。在此基础上,通过与实验数据进行了对比,分析了采用圆截面弹性细杆模型与椭圆截面弹性细杆模型分别模拟A-,B-,Z-DNA几何构型的可行性,并拟合了两种模型的r0-h曲线。同时,分析了弹性细杆截面的几何特性对螺旋带模型几何构型的影响。第六部分通过将外力势能项引入弹性细杆的能量密度函数,在弹性曲杆模型的Euler-Lagrange方程组基础上,推导出DNA弹性细杆在端部拉伸力作用下的Euler-Lagrange方程组,并基于此对不同初始曲率与初始扭率的DNA弹性细杆模型的拉伸稳定性进行了初步分析。(本文来源于《南京航空航天大学》期刊2016-06-01）
刘凤丽[2]（2005）在《电子相关效应和相对论效应对CuIn分子基态X~1∑~+平衡几何构型和稳定性的修正》一文中研究指出使用相对论与非相对论赝势,在HF、B3LYP水平上详细研究了电子相关效应和相对论效应对CuIn分子平衡几何构型和能量的影响。结果显示,电子相关效应缩短核间距,提高振动频率,降低能量;相对论效应加强了它的强度,使CuIn分子更加稳定。同时,在B3LYP水平上采用相对论有效核芯势(RCEP)进行能量扫描得到了CuIn分子势能曲线,给出CuIn分子的力参数和光谱数据。计算结果显示,得到的CuIn分子基态平衡几何、振动频率、解离能等与可得到的试验结果吻合。(本文来源于《东北林业大学学报》期刊2005年06期）
其木苏荣[3]（2003）在《LaO分子基态X~2Σ~+势能和平衡几何构型的比较研究》一文中研究指出采用叁种相对论有效核芯势 (LanL2DZ ,AREP ,RCEP)和价电子基组在MP2、B3LYP、CCSD(T)和QCISD(T)水平上计算了LaO分子基态平衡几何构型和能量 ,并对各种计算方法在不同基组下的计算效率和精度等进行了综合比较。在此基础上 ,选用B3LYP方法进行能量扫描得到了LaO分子势能曲线。计算得到的LaO分子基态平衡几何 ,振动频率、解离能和力常数等均与实验结果吻合。最后对赝势方法计算的误差原因进行了分析。(本文来源于《原子与分子物理学报》期刊2003年04期）
陈文凯,许娇,黄蔚艳,陆春海,张燕静[4]（2002）在《N_8分子平衡几何构型的预测》一文中研究指出用 CNDO/2半经验量子化学计算方法对 N8分子平衡几何构型作了预测 ,从计算结果看拱桥式结构为最稳定的构型 ,正方体型、畸变的拱桥式和正八面体型结构为较稳定构型 ,带二个双键的七员环构型是最不稳定的构型 .(本文来源于《科技通报》期刊2002年01期）
查福标,林传易,谢先德,王一波[5]（1992）在《[BO_3]、[BO_4]的平衡几何构型和单电子性质的理论研究》一文中研究指出本文利用分子轨道理论从头计算法(ab initio)、半经验的MNDO法、多重散射X_α方法(MS-X_α)对[BO_3]、[BO_4]阴离子基团进行了理论研究,计算了它们的平衡几何构型、伸缩振动力常数和振动频率、单电子性质(主要是四极耦合常数),取得了比较令人满意的结果。(本文来源于《矿物学报》期刊1992年04期）
范康年,肖鹤鸣,李永富[6]（1989）在《硝胺及其甲基衍生物的从头计算研究——Ⅰ.平衡几何构型的全优化》一文中研究指出我们用移植的TEXAS梯度法从头计算程序,选取STO-4-21G基组,对硝胺、甲硝胺和二甲硝胺等分子的平衡几何构型进行了全优化计算。其C-N,N-H和C-H等健长的计算结果以4-21G基组的标准校正值校正之后,所得理论预测值与实验数据良好相符。对N-N,N-O键长以及键角、两面角等构型参数,对照计算和实验结果进行了讨论。(本文来源于《化学学报》期刊1989年10期）
江德林,陈治文[7]（1986）在《亚甲基二硝胺分子的平衡几何构型的量子化学计算(CNDO/2)及其热安定性与分子结构的关系》一文中研究指出本文用CNDO/2计算了亚甲基二硝胺分子的平衡几何构型,提出了键能-双原子作用能换算关系式。文中将CH_2=N(NO_2)和HN(NO_2)—CH_2—N(NO_2)H两个分子中的双原子作用能换算为相应化学键的键能,取得较好的结果。根据分子结构及其对化学键强度的影响,本文还讨论了它的热安定性与分子结构的关系。(本文来源于《兵工学报》期刊1986年02期）
平衡几何构型论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
使用相对论与非相对论赝势,在HF、B3LYP水平上详细研究了电子相关效应和相对论效应对CuIn分子平衡几何构型和能量的影响。结果显示,电子相关效应缩短核间距,提高振动频率,降低能量;相对论效应加强了它的强度,使CuIn分子更加稳定。同时,在B3LYP水平上采用相对论有效核芯势(RCEP)进行能量扫描得到了CuIn分子势能曲线,给出CuIn分子的力参数和光谱数据。计算结果显示,得到的CuIn分子基态平衡几何、振动频率、解离能等与可得到的试验结果吻合。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
平衡几何构型论文参考文献
[1].萧业.基于空间弹性细杆模型的DNA平衡几何构型与稳定性研究[D].南京航空航天大学.2016
[2].刘凤丽.电子相关效应和相对论效应对CuIn分子基态X~1∑~+平衡几何构型和稳定性的修正[J].东北林业大学学报.2005
[3].其木苏荣.LaO分子基态X~2Σ~+势能和平衡几何构型的比较研究[J].原子与分子物理学报.2003
[4].陈文凯,许娇,黄蔚艳,陆春海,张燕静.N_8分子平衡几何构型的预测[J].科技通报.2002
[5].查福标,林传易,谢先德,王一波.[BO_3]、[BO_4]的平衡几何构型和单电子性质的理论研究[J].矿物学报.1992
[6].范康年,肖鹤鸣,李永富.硝胺及其甲基衍生物的从头计算研究——Ⅰ.平衡几何构型的全优化[J].化学学报.1989
[7].江德林,陈治文.亚甲基二硝胺分子的平衡几何构型的量子化学计算(CNDO/2)及其热安定性与分子结构的关系[J].兵工学报.1986