水稻黄单胞菌tal (transcription activator-like)基因功能研究

水稻黄单胞菌tal (transcription activator-like)基因功能研究

论文摘要

水稻的两个模式病原菌水稻细菌性条斑病菌(简称水稻条斑病菌)(Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, Xoc)和水稻白叶枯病菌(X. oryzae pv. oryzae, Xoo)同属于稻黄单胞菌种下致病变种,分别引起水稻细菌性条斑病(bacterial leaf streak, BLS)和水稻白叶枯病(bacterial blight, BB). BB是水稻上最为严重的病害之一,而BLS也趋于逐年加重。水稻是世界上主要粮食作物和作物生物学的模式植物,研究Xoo及Xoc与其的互作对于世界粮食安全问题意义重大。水稻白叶枯病菌与水稻互作符合基因对基因关系,不同小种中存在特异的tal家族基因。PX099A是Xoo代表菌株菲律宾6号小种,2008年PX099A全基因组信息发布,该菌株中的19个tal基因以9个簇的形式存在。为了揭示tal基因在水稻上的毒性贡献、在水稻上的互作关系以及tal基因间的协同性和抑制性,本研究根据PX099A菌株的基因组学特性,依据tal基因结构上的保守性和大小不同,对其19个tal基因进行了分离,成功获得17个tal基因(19个tal基因中有2对相同),并将这17个tal基因构建到研究tal基因功能的通用载体pUAV45K(B)中。这为揭示tal基因在水稻上的毒性贡献奠定了材料基础。水稻条斑病菌中存在20多个在结构上高度保守的tal的贡献,为了研究其功能,逐一减少水稻条斑病菌中的tal基因数量,据认为是较好的技术途径。本研究依据tal基因结构上的保守性,利用同源重组策略,借助自杀性载体pKMS1介导,对水稻条斑病菌RS105菌株中的tal基因进行了敲除。结果发现,同源交换可通过基因内和基因间重组实现tal基因敲除。PCR和Southern杂交结果显示,水稻条斑病菌中有5个tal基因被成功敲除,表明水稻条斑病菌tal基因敲除体系构建成功。毒性测定结果表明随着tal基因缺失数目的增多,突变体菌株的毒性减弱。这为逐一评价tal基因的毒性或/和无毒性功能奠定了基础。水稻条斑病菌与水稻白叶枯病菌在DNA水平上有大于90%的相似性,它们侵染寄主的方式不同,在水稻上激发的抗性基因也有很大不同。两种菌都含有大量的tal基因,但是Xoc中的tal基因功能还不清楚。本研究对Xoc的RS105菌株的tal基因进行分离,将分离得到的单个tal基因分别构建到含来自于Xoo的avrXa7和avrXa10的载体中。为分别在含有Xa7和XalO的抗性水稻品种IRBB7和IRBB10中表达,以探寻在Xoc中抑制avrXa7和avrXa10表达的抑制因子建立了筛选体系。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 文献综述
  • 水稻黄单胞菌tal基因的研究进展
  • 1 tal家族基因的命名
  • 2 tal家族基因的特征及在基因组中的分布
  • 3 tal家族基因的功能
  • 3.1 tal家族基因的无毒性作用
  • 3.2 tal家族基因的毒性作用
  • 3.3 tal家族基因先天免疫抑制作用
  • 4 tal家族基因的进化
  • 5 TAL box
  • 6 展望
  • 参考文献
  • 研究内容
  • A菌株tal基因的分离'>第一章 水稻白叶枯菌PX099A菌株tal基因的分离
  • 1 材料与方法
  • 1.1 菌株与质粒
  • 1.2 培养基
  • 1.3 所用抗生素的浓度
  • 1.4 主要试剂、PCR引物设计与合成
  • 1.5 tal基因BamHI片段的回收
  • 1.6 tal基因BamHI片段阳性克隆获取
  • 2 结果与分析
  • 2.1 获得含有tal基因片段的阳性克隆
  • 2.2 阳性克隆定位分析
  • 2.3 tal基因BamHI片段构建到通用载体
  • A突变体菌株中'>2.4 tal基因导入到PX099A突变体菌株中
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 第二章 水稻条斑病菌tal基因敲除及其毒性评价体系的建立
  • 1 材料与方法
  • 1.1 菌株和质粒
  • 1.2 引物的设计与合成
  • 1.3 培养基
  • 1.4 所用抗生素的浓度
  • 1.5 试剂与仪器
  • 1.6 敲除载体的构建
  • 1.7 基因敲除
  • 1.8 PCR检测
  • 1.9 Southern杂交验证
  • 1.10 水稻接种实验
  • 2 结果与分析
  • 2.1 水稻条斑病菌中至少存在20个以上的tal基因
  • 2.2 多个tal基因被敲除
  • 2.3 基因敲除机制分析
  • 2.4 tal基因缺失突变体在水稻上的病斑长度测定
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 第三章 水稻条斑病菌抑制avr-R互作的抑制因子筛选体系构建
  • 1 材料与方法
  • 1.1 菌株与质粒
  • 1.2 培养基
  • 1.3 所用抗生素的浓度
  • 1.4 主要试剂、PCR引物设计与合成
  • 1.5 RS105菌株中tal基因BamHI片段的回收
  • 1.6 tal基因BamHI片段阳性克隆获取
  • 1.7 阳性克隆的验证
  • 1.8 PBBS载体构建
  • 1.9 tal基因BamHI片段连接至PBBS载体
  • 1.10 tal基因分别构建到含avrXa7和avrXalO的pUAV45K(B)
  • 2 结果与分析
  • 2.1 获得含有RS105菌株tal基因片段的阳性克隆
  • 2.2 阳性克隆定位分析
  • 2.3 PBBS载体的构建
  • 2.4 实现RS105菌株来源的tal基因连接至PBBS
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 全文总结
  • 硕士期间发表论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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