固始鸡不同品系及部分外来鸡种之间遗传多样性的微卫星

论文摘要

本研究利用选自家禽基因组中的10个微卫星标记,通过对固始鸡5个系及配套系(固始鸡快羽系、固始鸡慢羽系、固始鸡原种、固始鸡父母代、固始鸡商品代)及4个非固始鸡品系及配套系(绿壳蛋鸡、星红褐蛋鸡、罗曼蛋鸡、艾维茵肉鸡)的多态性扩增,计算出各个群体在这10个微卫星标记座位上的等位基因频率、微卫星的多态信息含量(PIC)、各群体的遗传杂合度(H)、群体间的遗传距离(D_A),并根据遗传距离对这9个种群进行了UPGMA聚类分析;通过标记多态性与体型参数和屠体性状的最小二乘分析和多重比较,进行了分子标记与这些性状的相关分析。结果表明: 所选用的10对微卫星引物中,有2对微卫星引物呈单态外,其余的均表现出丰富的多态性。每个微卫星标记平均检测到4个等位基因(3—5),8对微卫星标记的平均多态信息含量为0.4841(0.3481—0.5990)。由不同微卫星标记座位所反映的各群体杂合度具有较大的差异:罗曼蛋鸡(L)群体具有最高的杂合度(H=0.7381),而星红褐蛋鸡(X)群体杂合度最低(H=0.5748),在固始鸡的5个群体中,固始鸡快羽系(K)和固始鸡慢羽系(M)的群体杂合度偏低,分别为(H=0.5955)和(H=0.5914),固始鸡原种(C)、固始鸡父母代(F)、固始鸡商品代(S)的群体杂合度偏高,分别为(H=0.6121)、(H=0.6191)和(H=0.6260),9个群体的平均杂合度为0.6220。所计算的遗传距离结果表明:艾维茵鸡(A)与其它各个群体间的遗传距离最大(0.0769—0.3368,平均为0.2367),星红褐鸡(X)与其它各个群体间的遗传距离较大(0.0117—0.3368,平均为0.2037),固始鸡慢羽系(M)、固始鸡快羽系(K)、固始鸡原种(C)、固始鸡父母代(F)、固始鸡商品代(S)这5个群体与其它各个群体间的遗传距离较小。聚类分析结果表明:星红褐鸡(X)与绿壳蛋鸡(J)以很小的距离首先被聚为一类,然后是固始鸡慢羽(M)与固始鸡快羽(K)被聚为一类,然后与固始鸡原种聚为一类,固始鸡父母代(F)与固始鸡商品代(S)又被聚为另一类,固始鸡被聚为一大类,罗曼鸡(L)自成一类,艾维茵鸡(A)也自成一类。这些试验结果与各群体的育种历史基本一致,说明微卫星标记可以用于种内不同群体间的系统起源和发育研究,是畜禽遗传多样性研究与保护的有效分析手段。 通过最小二乘分析标记与体型参数检测到4个标记MCW0295、MCW0006、MCW0185、ADL0192与5个性状(体重、胸宽、胸深、胫长、体斜长)存在显著相关,在各个群体中,标记MCW0295与体重相关比较显著,标记ADL0192与体斜长相关。在固始鸡群体中,标记MCW0006和MCW0185与体型参数各个性状相关比较显著。 标记的多态性与屠体性状相关关系:采用SAS统计软件中的非均衡数据的方差分析(GLM)对标记座位与各群体屠体性状指标(屠宰率、半静膛率、全静膛率、胸肌率、腿肌率、腹脂率)6个性状不同标记位点基因型间表型均值是否存在显著性差异(P<0.05)。检测到3个标记分别与3种性状存在不同程度的相关:在固始鸡原种、父母代中,标记MCW0295与胸肌率相关。在固始鸡原种和商品代中,标记MCW0006与全净膛率相关。在艾维茵鸡中,

论文目录

• 中文摘要
• 1 文献综述
• 1.1 我国地方鸡种遗传多样性研究
• 1.1.1 形态学水平的遗传多样性
• 1.1.2 细胞学水平的遗传多样性
• 1.1.3 蛋白质水平的遗传多样性分
• 1.1.4 DNA水平的遗传多样性
• 1.2 DNA分子标记及其在畜禽遗传多样性研究中的应用
• 1.2.1 RFLP技术
• 1.2.2 AFLP标记
• 1.2.3 RAPD技术
• 1.2.4 DNA指纹技术
• 1.2.5 微卫星DNA
• 1.3 微卫星DNA及其在畜禽遗传育种中的应用
• 1.3.1 微卫星DNA标记的原理
• 1.3.2 微卫星DNA标记的优越性
• 1.3.3 微卫星DNA标记在畜禽遗传育种中的应用
• 1.4 微卫星DNA在家禽中的应用现状
• 1.4.1 生产性能
• 1.4.2 产肉性能
• 1.4.3 其它
• 2 引言
• 3 材料与方法
• 3.1 试验材料
• 3.2 实验方法
• 3.3 统计分析
• 4 结果与分析
• 4.1 扩增产物的电泳结果
• 4.2 微卫星多态性
• 4.2.1 等位基因及基因频率
• 4.2.2 多态信息含量
• 4.2.3 群体杂合度
• 4.2.4 群体间遗传距离
• 4.2.5 聚类分析结果
• 4.3 标记的多态性与性状相关关系
• 4.3.1 标记的多态性与体型参数相关关系
• 4.3.2 标记的多态性与屠体性状相关关系
• 5 结论与讨论
• 5.1 试验结果分析
• 5.1.1 微卫星DNA标记与多态性
• 5.1.2 标记的选择及其与性状的相关
• 5.2 实验分析技术
• 5.2.1 PCR反应条件
• 5.2.2 PCR产物检测
• 5.3 遗传多样性及其在家禽育种中的作用
• 5.4 结论
• 参考文献
• 英文摘要