本文主要研究内容
作者朱镜璇,于正飞,刘野,詹冬玲,韩佳睿,田晓翩,韩葳葳（2019）在《基于分子动力学模拟提高嗜热磷酸三酯酶样内酯酶非特异性底物活力的理论研究》一文中研究指出：采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W263T)结合的构象变化,分析了Loop8中重要残基Trp263的突变提高SsoPox非特异性底物活力的原因,发现其能够影响门控残基Phe229的构象变化,导致活性口袋入口变宽(Phe229与Tyr99之间的距离变大),使对氧磷和内酯更容易结合到蛋白质的活性位点上; Asp256和Arg223形成盐桥的几率高于野生型(WT) SsoPox,在Arg223(位于Loop7)的协助下质子更加高效地从活性中心的Asp256(位于Loop8)传递到溶剂中去,因而能够提高SsoPox水解底物的效率.通过比较2个野生型复合物的结构稳定性和结合自由能差异,发现在模拟过程中SsoPox与内酯的复合物体系更加稳定并且具有更低的结合自由能,有利于SsoPox识别底物并使其埋在活性部位的疏水环境中,促进氢氧化物亲核进攻底物的亲电中心.因此,底物与酶稳定的相互作用可能是SsoPox具有天然内酯酶活性的原因之一.
Abstract
cai yong fen zi dong li xue mo ni he la shen fen zi dong li xue mo ni fang fa ,jie ge fen zi li xue -an yi bo en biao mian ji (MM-GB/SA)fang fa jin hang zi you neng ji suan he jie gou jiao hu zhi wen fen xi ,yan jiu le mo ni guo cheng zhong fei te yi xing de wu (dui yang lin /nei zhi )fen bie yu shi re lin suan san zhi mei yang nei zhi mei (SsoPox)ye sheng xing he tu bian ti (W263F/W263T)jie ge de gou xiang bian hua ,fen xi le Loop8zhong chong yao can ji Trp263de tu bian di gao SsoPoxfei te yi xing de wu huo li de yuan yin ,fa xian ji neng gou ying xiang men kong can ji Phe229de gou xiang bian hua ,dao zhi huo xing kou dai ru kou bian kuan (Phe229yu Tyr99zhi jian de ju li bian da ),shi dui yang lin he nei zhi geng rong yi jie ge dao dan bai zhi de huo xing wei dian shang ; Asp256he Arg223xing cheng yan qiao de ji lv gao yu ye sheng xing (WT) SsoPox,zai Arg223(wei yu Loop7)de xie zhu xia zhi zi geng jia gao xiao de cong huo xing zhong xin de Asp256(wei yu Loop8)chuan di dao rong ji zhong qu ,yin er neng gou di gao SsoPoxshui jie de wu de xiao lv .tong guo bi jiao 2ge ye sheng xing fu ge wu de jie gou wen ding xing he jie ge zi you neng cha yi ,fa xian zai mo ni guo cheng zhong SsoPoxyu nei zhi de fu ge wu ti ji geng jia wen ding bing ju ju you geng di de jie ge zi you neng ,you li yu SsoPoxshi bie de wu bing shi ji mai zai huo xing bu wei de shu shui huan jing zhong ,cu jin qing yang hua wu qin he jin gong de wu de qin dian zhong xin .yin ci ,de wu yu mei wen ding de xiang hu zuo yong ke neng shi SsoPoxju you tian ran nei zhi mei huo xing de yuan yin zhi yi .
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自高等学校化学学报的朱镜璇,于正飞,刘野,詹冬玲,韩佳睿,田晓翩,韩葳葳，发表于刊物高等学校化学学报2019年01期论文，是一篇关于嗜热类磷酸三酯酶样内酯酶论文,分子动力学模拟论文,拉伸分子动力学模拟论文,分子力学广义玻恩表面积论文,结构交互指纹分析论文,高等学校化学学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自高等学校化学学报2019年01期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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