十字花科黑腐病菌锌吸收调控蛋白基因zur启动子的研究

十字花科黑腐病菌锌吸收调控蛋白基因zur启动子的研究

论文摘要

在细菌中,锌吸收调控蛋白Zur(zinc uptake regulator)(由zur基因编码)的主要功能是当细胞内锌离子浓度过高时抑制锌吸收系统的表达。但是,本实验室的研究表明,在十字花科黑腐病菌(Xanthomonascampestris pv.campestris)中,zur(基因编号为XC1430)除了调控锌离子平衡外,还参与了该菌的致病过程和EPS产生。在完成zur基因的功能鉴定后,本实验室还对zur基因的启动子进行了初步研究,推测zur基因可能存在两个独立的启动子P1(基因组注释的ATG前面114 bp)和P2(基因组注释的zur基因读码框内,ATG下游63 bp处的另一个翻译起始密码子GTG前108 bp)。为了证实这一假设,本研究分别构建了启动子P1和P2与无启动子gusA基因的融合报告质粒pL6PlgusA和pL6P2gusA,并检测它们在野生型菌株8004中的GUS活性,结果表明,P1和P2均有启动子活性;进一步的实验研究结果表明P1和P2的表达均不受锌离子的影响。为了确定P1和P2的转录起始位点,我们进行了5′-RACE实验,结果表明在ATG上游23 bp处的A碱基是P1的转录起始位点,但是在我们所用的实验条件下没有检测到P2的转录起始位点。由于GUS活性结果表明P1和P2都具有启动子活性,因此我们推测zur既可以从ATG起始也可以从GTG起始翻译,分别编码两种Zur蛋白即ZurL(从ATG起始)和ZurS(从GTG起始)。为了证实这一点,我们分别构建了带有翻译起始密码子ATG→ATA和GTG→GTA点突变的zur基因的质粒pL6zurATG和pL6zurGTG并分别导入zur的缺失突变体中,然后对点突变互补菌进行锌敏感性、EPS产量以及致病性进行检测。结果发现,将GTG点突变后(只能合成ZurL蛋白),重组质粒pL6zurATG可以互补zur突变体的锌敏感、致病力和EPS合成表型;而将ATG点突变后(只能合成ZurS蛋白),重组质粒pL6zurGTG可以互补突变体的致病力、EPS合成而不能互补其锌敏感表型,表明从ATG起始或从GTG起始编码的蛋白均有生物学功能,且在功能有交叉也有差异:从ATG起始编码的蛋白ZurL具有锌平衡、EPS合成、致病调控功能,而从GTG起始编码的蛋白ZurS,只有EPS合成、致病调控功能而没有锌平衡功能。为了进一步鉴定ZurL和ZurS蛋白是否存在,我们在NYGB培养条件下对点突变互补菌株和缺失突变体菌株的Zur蛋白进行了Western blotting检测,结果发现在点突变体菌株的细胞提取物均能检测到一条杂交带,而在缺失突变体菌株的细胞提取物中未能检测到杂交带,其结果表明在各自的点突变互补菌株中ZurL和ZurS是存在的,其结果与点突变体的表型检测结果相符。但Western blotting检测野生型菌株Xcc 8004的细胞提取物时,未能检测到两条杂交带。以上这些结果证明,(1)除了ATG前面的启动子(P1)外,zur基因读码框内GTG上游-108 bp区域(P2)具有启动子活性;(2)从ATG起始编码的蛋白ZurL具有锌平衡、EPS合成、致病调控功能,而从GTG起始编码的蛋白ZurS,只有EPS合成、致病调控功能而没有锌平衡功能。但在所用的实验条件下,用Western blotting未能检测到Xcc 8004细胞内有两种Zur蛋白。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 前言
  • 1.1 十字花科黑腐病菌及其致病机理研究进展
  • 1.1.1 十字花科黑腐病菌
  • 1.1.2 十字花科黑腐病菌的致病因子
  • 1.2 细菌的锌代谢平衡机制及调控研究进展
  • 1.2.1 细菌的锌离子排放系统及其调控
  • 1.2.2 细菌的锌离子吸收系统及其调控
  • 1.2.3 锌吸收调控蛋白(Zur)的研究进展
  • 1.2.4 十字花科黑腐病菌8004的zur基因
  • 1.3 本工作的目的与内容
  • 第二章 材料与方法
  • 2.1 菌株和质粒
  • 2.2 常用抗生素和其它试剂
  • 2.3 培养基
  • 2.4 溶液与缓冲液
  • 2.5 实验所用菌株的培养条件和保存方法
  • 2.6 常规PCR反应
  • 2.7 融合PCR反应
  • 2.8 琼脂糖凝胶电泳
  • 2.9 PCR产物的回收与纯化
  • 2.10 限制性内切酶酶切
  • 2.11 DNA连接
  • 2.12 电脉冲感受态细胞的制备
  • 2.13 转化
  • 2.14 三亲本接合
  • 2.15 总DNA的提取
  • 2.16 质粒的提取
  • 2.17 胞外多糖的检测
  • 2.18 植株的致病性实验
  • 2.19 锌敏感性实验
  • 2.20 GUS(β-葡糖苷酸酶)活性检测
  • 2.21 总蛋白的提取
  • 2.22 Western blotting
  • 2.24 Xcc总RNA的提取及去除DNA污染
  • 2.25 5′—RACE
  • 2.26 zur缺失突变体的构建
  • 2.27 缺失突变体的互补
  • 第三章 结果与分析
  • 3.1 P1和P2均有启动子活性
  • 3.1.1 启动子与gusA基因转录融合报告质粒的构建
  • 3.1.2 报告质粒的GUS活性
  • 3.2 启动子P1和P2的表达不受锌离子的影响
  • 3.3 zur转录起始位点的确定
  • 3.4 zur可能编码两个功能不同的蛋白
  • 3.4.1 缺失突变体的构建
  • 3.4.2 缺失突变体互补菌株的构建
  • 3.4.3 起始密码子点突变互补菌株的构建
  • 3.4.4 点突变互补菌株的锌敏感检测
  • 3.4.5 点突变互补菌株的致病性检测
  • 3.4.6 点突变互补菌株的EPS产量检测
  • 3.4.7 zur是否编码两个蛋白的Western blotting验证
  • 第四章 结论与讨论
  • 4.1 结论
  • 4.2 讨论
  • 4.2.1 关于zur缺失突变体的构建
  • 4.2.2 关于两个起始密码子突变所用的点突变方法
  • 4.2.3 关于Xcc 8004中zur的启动子
  • 4.2.4 关于Xcc 8004中锌离子对zur表达的影响
  • 4.2.5 关于细菌中一个基因编码多个蛋白的现象
  • 4.2.6 关于ZurL和ZurS
  • 参考文献
  • 致谢
  • 相关论文文献

    • [1].结核分枝杆菌FurB(Zur)研究进展[J]. 辽宁师专学报(自然科学版) 2008(04)
    • [2].水稻白叶枯病菌Zur和HrpG平行调控hrcC基因表达[J]. 植物病理学报 2020(05)

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