水稻OsSZF1基因的克隆与其功能初步分析

水稻OsSZF1基因的克隆与其功能初步分析

论文摘要

水稻是世界三大粮食作物之一,进行水稻研究,培育优良水稻品种具有十分重要的意义。水稻基因组测序的完成是水稻研究的一个里程碑,使人类在DNA水平上对水稻有了更深入的了解。中国是个水资源缺乏的国家,尽管不同的研究者从诸多方面对植物的抗旱作了大量的研究,但由于植物抗旱性是一个非常复杂的数量性状,涉及大量的功能各异的基因,其抗旱性的遗传机制一直不太清楚,所以抗旱相关基因的发掘是抗旱性研究的热点。本研究选用粳型旱稻品种“沪旱3号”为模式材料,在本研究室对抗旱QTL定位的基础上,,采用RT-PCR策略,从抗旱QTL区间克隆水稻逆境胁迫相关基因,并进行功能验证。通过SMART RACE技术,从EST片段的保守区,分别获得OsSZF1基因的3’和5’端序列,利用Vector NTI 8.0将保守区、3’和5’拼接后得到OsSZF1基因全长cDNA。通过相关的生物信息分析,获得一个开放阅读框,编码367个氨基酸,3’端有210bp的非翻译区,5’端也有182bp的非翻译区,具有保守的C3HC4结构,是典型的RING型锌指蛋白基因。通过RT-PCR技术,扩增水稻OsSZF1基因开放阅读框,Southern杂交分析表明OsSZF1基因在水稻基因组中为单拷贝。分别用3种不同浓度梯度的NaCl、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)和甘露醇(Mannitol)和甲基茉莉酸(m-JA)处理水稻幼苗1h后剪取叶片和根,抽提总RNA反转录成cDNA为模板,以3’非编码区设计引物,使用荧光定量PCR检测OsSZF1基因在不同处理的表达情况,结果显示OsSZF1基因受不同处理诱导表达,以ABA,NaCl的表达差异最大,水杨酸和甲基茉莉酸低浓度处理就可诱导OsSZF1基因表达,但随着处理浓度的升高表达反而下降,不同浓度甘露醇处理后,OsSZF1基因的表达量随着浓度的增加而增加,由此表明水稻OsSZF1基因和植物的抗逆性有关系,且该基因对不同浓度的处理有不同的应答,是ABA依赖的DNA表达蛋白。构建了植物表达载体pCAMBIA2300-OsSZF1,并通过冻融法将该重组质粒成功的导入根癌农杆菌菌株EHA105中,利用该农杆菌转化烟草。对转基因烟草苗的PCR分析和Southern blot分析表明,外源基因OsSZF1已经整合到了烟草的基因组中,其拷贝为单拷贝。由于时间的限制,该基因的功能还需进一步进行研究。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 缩略语表
  • 1.前言
  • 1.1.干旱对植物的影响
  • 1.2.水稻抗旱性的分子遗传研究
  • 1.3.基因克隆方法
  • 1.3.1.水稻基因克隆方法
  • 1.3.2.RACE在植物基因克隆上的技术优势
  • 1.4.植物转基因主要方法
  • 1.4.1 农杆菌介导转化法
  • 1.4.2.基因枪介导转化法
  • 1.4.3.花粉管通道法
  • 1.5.锌指蛋白研究现状
  • 1.6.生物信息学研究
  • 1.6.1 生物信息学的主要研究内容
  • 1.7.本文研究目的和意义
  • 2.材料与方法
  • 2.1.实验材料
  • 2.1.1.植物材料
  • 2.1.2.实验所用载体
  • 2.1.3.常用缓冲液
  • 2.1.4.酶和其他试剂
  • 2.1.5.常用实验仪器
  • 2.1.6.用于转化的培养基
  • 2.2.实验方法
  • 2.2.1.目的基因的选取
  • 2.2.2.基因结构和功能预测
  • 2.2.3.OsSZF1基因保守区克隆
  • 2.2.4.3'RACE获得3’端目的基因
  • 2.2.5.5'RACE获得5’端目的基因
  • 2.2.6.对获得的目的片断进行生物信息学分析
  • 2.2.7.全长cDNA开放阅读框的克隆
  • 2.2.8.OsSZF1基因在水稻Oryza sativa中拷贝数的分析
  • 2.2.9.OsSZF1的表达分析
  • 2.2.10.OsSZF1转基因研究
  • 2.2.11.转基因烟草的Southern杂交
  • 3.结果与分析
  • 3.1 目标基因的选取
  • 3.2 OsSZF1基因克隆
  • 3.3 OsSZF1基因在水稻中的拷贝数分析
  • 3.4 OsSZF1基因的表达分析
  • 3.5 转基因烟草的基因转入验证
  • 4.讨论
  • 4.1.植物表达载体的构建
  • 4.2.实验过程中总结的RACE技术的优缺点
  • 4.3.烟草幼苗被农杆菌污染的原因分析
  • 4.4.OsSZF1基因的酵母杂交
  • 4.5.OsSZF1基因的分析小结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录
  • 相关论文文献

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