王迪:大豆2S清蛋白基因生物信息学分析论文

王迪:大豆2S清蛋白基因生物信息学分析论文

本文主要研究内容

作者王迪,邱红梅,王曙明,高淑芹,马晓萍,王洋,郑大浩,王跃强(2019)在《大豆2S清蛋白基因生物信息学分析》一文中研究指出:2S清蛋白含有动物胰蛋白酶抑制剂及过敏原等多种具有生理活性的多肽,可引起特殊人群尤其是儿童的过敏反应,其编码基因为LTP基因家族。为系统地分析2S清蛋白编码基因,利用生物信息学分析方法获得2S清蛋白基因的全序列、定位以及转录本等信息,鉴定了30个大豆LTP家族基因。基因定位结果表明:23. 33%基因在染色体上串联排布,反映了该家族基因的串联重复进化。通过基因功能注释得到22个非特异性脂质转运蛋白,1个类伸展素蛋白,4个脯氨酸蛋白,2个种子储存2S清蛋白和1个雄蕊特殊蛋白。根据系统发育分析将这些蛋白分成3个类群。类群I有类伸展素蛋白、脯氨酸蛋白、雄蕊特殊蛋白和种子储存2S清蛋白,类群II有16个非特异性脂质转运蛋白,类群III有6个非特异性脂肪转移蛋白。种子储存2S清蛋白基因在种子发育中后期特异表达,表达量显著高于其它同源基因。本研究为进一步研究其功能提供指导,为该类基因应用于大豆品质改良提供理论支撑。

Abstract

2Sqing dan bai han you dong wu yi dan bai mei yi zhi ji ji guo min yuan deng duo chong ju you sheng li huo xing de duo tai ,ke yin qi te shu ren qun you ji shi er tong de guo min fan ying ,ji bian ma ji yin wei LTPji yin jia zu 。wei ji tong de fen xi 2Sqing dan bai bian ma ji yin ,li yong sheng wu xin xi xue fen xi fang fa huo de 2Sqing dan bai ji yin de quan xu lie 、ding wei yi ji zhuai lu ben deng xin xi ,jian ding le 30ge da dou LTPjia zu ji yin 。ji yin ding wei jie guo biao ming :23. 33%ji yin zai ran se ti shang chuan lian pai bu ,fan ying le gai jia zu ji yin de chuan lian chong fu jin hua 。tong guo ji yin gong neng zhu shi de dao 22ge fei te yi xing zhi zhi zhuai yun dan bai ,1ge lei shen zhan su dan bai ,4ge fu an suan dan bai ,2ge chong zi chu cun 2Sqing dan bai he 1ge xiong rui te shu dan bai 。gen ju ji tong fa yo fen xi jiang zhe xie dan bai fen cheng 3ge lei qun 。lei qun Iyou lei shen zhan su dan bai 、fu an suan dan bai 、xiong rui te shu dan bai he chong zi chu cun 2Sqing dan bai ,lei qun IIyou 16ge fei te yi xing zhi zhi zhuai yun dan bai ,lei qun IIIyou 6ge fei te yi xing zhi fang zhuai yi dan bai 。chong zi chu cun 2Sqing dan bai ji yin zai chong zi fa yo zhong hou ji te yi biao da ,biao da liang xian zhe gao yu ji ta tong yuan ji yin 。ben yan jiu wei jin yi bu yan jiu ji gong neng di gong zhi dao ,wei gai lei ji yin ying yong yu da dou pin zhi gai liang di gong li lun zhi cheng 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自大豆科学的王迪,邱红梅,王曙明,高淑芹,马晓萍,王洋,郑大浩,王跃强,发表于刊物大豆科学2019年01期论文,是一篇关于大豆论文,进化分析论文,差异表达论文,大豆科学2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自大豆科学2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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