控制水稻源库流性状关键基因Ess1的精细定位

控制水稻源库流性状关键基因Ess1的精细定位

论文摘要

水稻产量的提高过程,实质上是“源、库、流”性状的遗传改良与其平衡关系不断建立的过程。选育源强、库大、流通畅的高光效的理想株型品种是水稻高产、稳产的重要保障。研究控制“源、库、流”多性状的关键基因及其遗传机理,对高产、优质水稻品种的选育具有重要的理论和实践意义。近几年,通过对水稻突变体的研究,克隆了一大批有关叶片,穗部和籽粒大小性状的关键基因,但目前对同时控制“源、库、流”的关键基因研究较少。本文报道了一个来源于水稻中花.11的天然突变体essl,其表现为叶片早衰、株高变矮花粉育性降低、产量明显降低:电镜观察发现突变体ess1叶和茎的叶绿体、维管束发生严重畸变;叶绿素测定和抗氧化酶活力测定表明突变体essl的叶片中的叶绿素含量抗氧化酶活力都有很大程度降低;遗传分析发现该突变体的这些水稻库源流性状的改变由单基因(位点)突变所致;利用分子标记将该突变基因精细定位于57KB范围内,进一步分析发现基因LOC二Os05g48360是控制水稻“源-库-流”的关键基因。这些研究结果为理解整个水稻生长发育、衰老以及影响水稻源、库、流分配的分子机制打下基础。主要结果如下:1.田间农艺性状调查结果表明,与野生型中花-11相比,突变体essl的株高降低20.9%,二级枝梗数减少46.1%,有效穗数减少73.5%,实粒数减少87.5%,倒节间变短19.5%,千粒重减少18.1%,生育期延长8天;I2-KI染色的结果表明,突变体essl中的可育花粉数极显著低于野生型中花-11;通过水培实验可发现,突变体ess1的根系明显较野生型不发达。2.我们通过扫描电镜观察重要组织的维管束,发现在突变体essl的叶片和茎秆中的维管束发育畸形、结构不完整,严重影响了同化物、水和无机盐的运输:通过透射电镜观察叶绿体的形态,在苗期中的突变体ess1出现表型部分的叶绿体出现嗜锇颗粒,这一现象在分蘖期时更为严重,发展到抽穗期时叶绿体出现间隙,而野生型中花-11的叶绿体形态结构正常。3.利用essl分别和日本晴、93-11和蜀恢527做杂交构建遗传群体,并对其F2遗传分离群体进行表型调查,结果发现正常植株和突变植株的比例经卡方检验符合3:1的比例,同时调查发现所有突变单株都同时具有早衰和源库流性状变化,如株高变矮、穗长变短、二级枝梗数和实粒数减少等,这一结果表明,控制该突变体的早衰和源库流性状变化是同一单基因突变所致,并呈隐性遗传。4.利用9311/essl的F2作图群体,对突变体essl进行分子标记定位,最终将Essl定位在5号染色体短臂上靠近端粒的区,位于Indel分子标记16和18之间,其物理距离为57.68KB。5.利用Rice Genome Annotation Project数据库对定位区间内的基因进行预测,共获得9个基因。其中LOCOs05g48390为已克隆的与叶尖坏死相关的基因,但是通过扩增其cds全长和启动子区域并没发现有突变位点,表达量在突变体和野生型之间差异也不明显,故将其排除掉。通过调查定位区间内的基因的表达谱,发现LOCOs05g48360特异地在根和叶片中表达量很高,通过聚类分析发现了其同源的拟南芥中基因AT1G28380,它们都编码一个含有MACPF功能域的蛋白,且AT1G28380的突变体也变现出早衰。故推测该基因可能是控制essl突变表型的一个新基因。6.选择分析了4个衰老相关基因(SAR)突变体essl和野生型中花-11中的表达情况,结果显示4个衰老相关基因的表达在突变体essl中都明显升高,其中Os1295、Os155和Os120的表达量是在突变体出现表型后上升,而Osh69的表达量在表型出现之前就特异性地升高,这些结果表明衰老基因Os1295、Os155、Os120和Os69都参与了水稻essl的衰老过程,其中Osh69参与到essl的早衰过程的初期阶段。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 作物源库流的研究进展
  • 1.1 源库流的概念
  • 1.2 源、库、流在水稻产量形成中的贡献
  • 1.3 影响水稻库源流关系的因素
  • 1.4 在水稻中已克隆的源库流相关基因
  • 2 植物衰老研究进展
  • 2.1 植物的衰老概述
  • 2.2 水稻早衰研究进展
  • 2.3 与衰老相关基因的克隆
  • 3 研究的目的意义及立项依据
  • 3.1 新基因的发掘和育种应用对保障我国粮食安全具有重要意义
  • 3.2 “源、库、流”和早衰的综合性状的基因功能研究是提高水稻产量的遗传基础
  • 3.3 精细定位和克隆控制源库流性状关键基因为分子育种提供基因资源
  • 第二章 材料与方法
  • 1 试验材料
  • 1.1 供试材料
  • 1.2 主要试剂
  • 1.3 实验主要仪器和设备
  • 1.4 培养基配方
  • 2 试验方法
  • 2.1 花粉育性观察
  • 2.2 石蜡切片
  • 2.3 扫描电镜观察
  • 2.4 透射电镜观察
  • 2.5 叶绿素、SOD和POD酶的测定
  • 2.6 突变体的遗传分析与基因定位
  • 2.7 定位区间内的基因克隆与测序
  • 2.8 定位区间内基因和SAGs(衰老相关基因)表达情况
  • 第三章 结果与分析
  • 1 表型分析
  • 2 农艺性状调查结果
  • 3 叶和茎的维管束组织观察
  • 4 叶绿素、SOD和POD的测定
  • 5 叶绿体透射电镜观察
  • 6 ess1基因定位
  • 6.1 遗传分析
  • 6.2 ess1的初定位
  • 6.3 ess1的精细定位及预测基因
  • 7 SAGs(衰老相关基因)表达情况
  • 第四章 讨论
  • 1 ess1是未被克隆的新基因
  • 2 ess1基因的多效性
  • 3 ess1突变体衰老的分子机理
  • 4 突变体ess1衰老分子机制的推测
  • 5 后续研究设想
  • 5.1 克隆ess1基因
  • 5.2 转基因功能互补和干涉实验
  • 5.3 蛋白ESS1介导的衰老的分子机制
  • 参考文献
  • 补充图
  • 致谢
  • 相关论文文献

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