论文题目: 基于分子数据与形态特征的茧蜂科系统发育学研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 农业昆虫与害虫防治
作者: 时敏
导师: 陈学新
关键词: 膜翅目,茧蜂科,内茧蜂亚科,矛茧蜂亚科,蝇茧蜂亚科,蚜茧蜂亚科,优茧蜂亚科,甲腹茧蜂亚科,系统发育,形态特征
文献来源: 浙江大学
发表年度: 2005
论文摘要: 本文对茧蜂科Braconidae的亚科级分类单元以及蝇茧蜂亚科Opiinae、内茧蜂亚科Rogadinae、优茧蜂亚科Euphorinae、甲腹茧蜂亚科Cheloninae、矛茧蜂亚科Doryctinae和蚜茧蜂亚科Aphidiinae等亚科内的属级分类单元进行了系统发育和进化研究。论文分为5个章节:文献综述、实验方法与原理、茧蜂科内6亚科的系统发育研究、茧蜂科的系统发育研究、总结和讨论。 第一章回顾了国内外茧蜂科Braconidae的研究历史,介绍了分类沿革、形态学、生物学和系统发育等方面的研究概况;第二章具体介绍了实验方法、实验步骤、分析软件及所依据的原理;第三章中,根据现有相应类群茧蜂专家认可的分类系统,对6个亚科内的类群分别进行分子数据与形态特征相结合的系统发育研究,在国内首次利用同源的核糖体28S rDNA D2变异区、线粒体16S rDNA和线粒体Cytb基因并结合成虫外部形态特征以PAUP(最大简约法MP)和MrBayes(最大似然法ML)对蝇茧蜂亚科Opiinae内10属22种,利用同源的核糖体28S rDNA D2变异区基因结合成虫外部形态特征对以PAUP(最大简约法MP)和MrBayes(最大似然法ML)对内茧蜂亚科Rogadinae中12属44种、优茧蜂亚科Euphorinae中19属23种、甲腹茧蜂亚科Cheloninae中8属9种和矛茧蜂亚科Doryctinae中15属16种,以及利用同源的线粒体ATPase 6、线粒体16S rRNA和核糖体18S rDNA基因并结合成虫外部形态特征以PAUP(最大简约法MP、邻近法NJ和最大似然法ML)和MrBayes(最大似然法ML)对蚜茧蜂亚科Aphidiinae中10属23种进行了系统发育研究;第四章中,以现有的茧蜂分类系统为基础,在国际上首次使用了线粒体16S rDNA、核糖体28S rDNA D2变异区的序列片段和核糖体18S rDNA这3个基因结合96个形态学特征以PAUP(最大简约法MP按不同的形态特征权重设置)和MrBayes(最大似然法ML以形态特征等权设置)对茧蜂科的35个亚科88属100种进行了系统发育分析。第五章中,对论文的研究内容作出总结。 研究共得到以下结果: (1) 共向GenBank中提交新序列78条,涉及茧蜂科29属44种,包含5种基因。 (2) 在茧蜂科内线粒体基因序列为“AT”碱基丰富序列,线粒体基因序列的转换低于颠换,而核糖体基因序列的颠换低于转换。 (3) 将内茧蜂亚科Rogadinae内的种类分成4个单系族(阔跗茧蜂族Yeliconini、横纹茧蜂族Clinocentrini、潜蛾茧蜂族Stiropiini和内茧蜂族Rogadini)合乎系统发育关系,并且横纹茧蜂族Clinocentrini处于系统发育树的基部位置;同时获得关于内茧蜂亚科Rogadinae中脊茧蜂属Aleoides新的分类系统,将其内部划分为4个亚属,即:新内茧蜂亚属Neorhogas、甲内茧蜂亚属Chelonorhogas、脊茧蜂亚属Aleoides和异配茧蜂亚属Heterogamus。
论文目录:
致谢
中文摘要
英文摘要
前言
第一章 文献综述
1.1 分类地位
1.2 分类沿革和分类系统
1.3 系统发育
1.3.1 研究概况
1.3.2 各大类群的支序关系
1.4 生物学特性
1.4.1 寄生习性
1.4.2 寄主
1.4.3 寄主类型的进化
1.5 地理分布
1.6 分子系统学研究
1.7 我国茧蜂科的研究概况
第二章 系统发育分析原理及方法概述
2.1 主要试剂和仪器
2.1.1 DNA提取试剂
2.1.2 PCR反应试剂
2.1.3 电泳试剂
2.1.4 主要仪器
2.2 实验方法
2.2.1 主要试剂的配制
2.2.2 基因组DNA的提取
2.3 PCR反应
2.3.1 PCR反应体系
2.3.2 PCR反应条件
2.3.3 PCR产物检测及测序
2.4 序列数据的获取
2.5 序列分析
2.6 形态特征的获取与特征分析
2.7 系统发育分析原理及方法概述
2.7.1 启发式(heuristic)搜索算法
2.7.2 贝叶斯方法
2.8 使用软件简介
2.8.1 PAUP*4.0软件
2.8.2 MrBayes 3.0软件
2.8.3 参数
2.9 选择外群
第三章 茧蜂科内各亚科的系统发育研究
第一节 内茧蜂亚科Rogadinae的系统发育研究
3.1.1 材料与方法
3.1.1.1 样品材料
3.1.1.2 实验方法
3.1.1.3 序列联配及分析
3.1.1.4 形态特征矩征
3.1.1.5 外群的选择
3.1.1.6系统发育分析
3.1.2 系统发育分析结果
3.1.2.1 序列碱基组成分析结果
3.1.2.2 系统发育分析结果
第二节 矛茧蜂亚科Doryctinae的系统发育研究
3.2.1 材料与方法
3.2.1.1 样品材料
3.2.1.2 实验方法
3.2.1.3 序列联配及分析
3.2.1.4 形态特征矩征
3.2.1.5 外群的选择
3.2.1.6 系统发育分析
3.2.2 系统发育分析结果
3.2.2.1 序列碱基组成分析结果
3.2.2.2 系统发育分析结果
第三节 蝇茧蜂亚科Opiinae的系统发育研究
3.3.1 材料与方法
3.3.1.1 样品材料
3.3.1.2 实验方法
3.3.1.3 序列联配及分析
3.3.1.4 形态特征矩征
3.3.1.5 外群的选择
3.3.1.6 系统发育分析
3.3.2 系统发育分析结果
3.3.2.1 序列碱基组成分析结果
3.3.2.2 系统发育分析结果
第四节 蚜茧蜂亚科Aphidiinae的系统发育研究
3.4.1 材料与方法
3.4.1.1 样品材料
3.4.1.2 实验方法
3.4.1.3 序列联配及分析
3.4.1.4 形态特征矩征
3.4.1.5 外群的选择
3.4.1.6 系统发育分析
3.4.2 系统发育分析结果
3.4.2.1 序列碱基组成分析结果
3.4.2.2 系统发育分析结果
第五节 优茧蜂亚科Euphorinae的系统发育研究
3.5.1 材料与方法
3.5.1.1 样品材料
3.5.1.2 实验方法
3.5.1.3 序列联配及分析
3.5.1.4 形态特征矩征
3.5.1.5 外群的选择
3.5.1.6 系统发育分析
3.5.2 系统发育分析结果
3.5.2.1 序列碱基组成分析结果
3.5.2.2 系统发育分析结果
第六节 甲腹茧蜂亚科Cheloninae的系统发育研究
3.6.1 材料与方法
3.6.1.1 样品材料
3.6.1.2 实验方法
3.6.1.3 序列联配及分析
3.6.1.4 形态特征矩征
3.6.1.5 外群的选择
3.6.1.6 系统发育分析
3.6.2 系统发育分析结果
3.6.2.1 序列碱基组成分析结果
3.6.2.2 系统发育分析结果
第四章 茧蜂科Braconidae的系统发育研究
4.1 材料与方法
4.1.1 样品材料
4.1.2 实验方法
4.1.3 序列联配及分析
4.1.4 形态特征矩征
4.1.5 外群的选择
4.1.6 系统发育分析
4.2 系统发育分析结果
4.2.1 序列碱基组成分析结果
4.2.2 系统发育分析结果
4.2.2.1 在茧蜂亚科复合群(braconoid complex of subfamilies)内的关系
4.2.2.2 在长茧蜂亚科复合群(helconoid complex of subfamilies)内的关系
4.2.2.3 在小腹茧蜂亚科复合群(microgastroid complex of subfamilies)内的关系
第五章 总结与讨论
5.1 结果与讨论
5.2 创新之处
5.3 不足之处
5.4 今后的研究方向
参考文献
附录Ⅰ
附录Ⅱ
发布时间: 2005-07-22
参考文献
- [1].中国茧蜂亚科的分类及其系统发育研究[D]. 王义平.浙江大学2006
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- [7].中国斑腿蝗科部分种类分子系统学研究[D]. 芦荣胜.陕西师范大学2005
- [8].东亚鲤科鱼类的分子系统发育研究[D]. 王绪祯.中国科学院研究生院（水生生物研究所）2005
- [9].中国茧蜂亚科的分类及其系统发育研究[D]. 王义平.浙江大学2006
- [10].中国甲腹茧蜂属分类研究[D]. 张红英.浙江大学2008
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