许洋:沙冬青脱水素基因的分子克隆与序列分析论文

许洋:沙冬青脱水素基因的分子克隆与序列分析论文

本文主要研究内容

作者许洋,雷晨,佘露露,王瑾瑜,杨佳慧,陆雅宁,卢存福,陈玉珍(2019)在《沙冬青脱水素基因的分子克隆与序列分析》一文中研究指出:脱水素(Dehydrin)是晚期胚胎发生蛋白(LEA)家族中最具特色的一组蛋白,对植物抵抗非生物逆境胁迫起到非常重要的作用。本研究从抗逆性较强的常绿阔叶灌木沙冬青中克隆出4个含有完整ORF的脱水素基因,命名为AmDHN3.2F、AmDHN5.1F、AmDHN6.2F和AmDHN7.2,并进行了相关生物信息学分析。使用DNAMAN软件预测结果显示,4个蛋白都含有一个K片段和S片段。理化性质分析表明,4种脱水素蛋白均为亲水性蛋白,其中AmDHN3.2F为碱性蛋白,AmDHN5.1F、AmDHN6.2F和AmDHN7.2为酸性蛋白;理论相对分子质量最大的是AmDHN7.2(21.42kD),最小的是AmDHN3.2F(10.69kD);理论等电点最大的是AmDHN3.2F(9.01),最小的是AmDHN6.2F(6.21)。蛋白二级和三级结构预测结果发现,4种蛋白均由3种结构组成:α-螺旋(7.50%~32.63%)、无规则卷曲(55.79%~73.00%)和延伸链(11.58%~19.50%)。采用邻接法构建系统进化树,并结合同源相似性分析发现,4种脱水素蛋白均与蒺藜苜蓿Mt DHN3和拟南芥At DHN10亲缘关系较近。利用XSTREAM软件分析结果显示,Am DHN5.1F、Am DHN6.2F和Am DHN7.2第3个蛋白序列具有串联重复单元,且主要集中在脱水素的中间部分。通过DOTTER软件生成点阵图发现,在中间区域存在大量的短片段重复,说明脱水素序列的收缩或扩张主要发生在中间部分。这些研究结果为进一步开展沙冬青DHN基因家族的功能分析奠定了基础。

Abstract

tuo shui su (Dehydrin)shi wan ji pei tai fa sheng dan bai (LEA)jia zu zhong zui ju te se de yi zu dan bai ,dui zhi wu di kang fei sheng wu ni jing xie pai qi dao fei chang chong yao de zuo yong 。ben yan jiu cong kang ni xing jiao jiang de chang lu kuo xie guan mu sha dong qing zhong ke long chu 4ge han you wan zheng ORFde tuo shui su ji yin ,ming ming wei AmDHN3.2F、AmDHN5.1F、AmDHN6.2Fhe AmDHN7.2,bing jin hang le xiang guan sheng wu xin xi xue fen xi 。shi yong DNAMANruan jian yu ce jie guo xian shi ,4ge dan bai dou han you yi ge Kpian duan he Spian duan 。li hua xing zhi fen xi biao ming ,4chong tuo shui su dan bai jun wei qin shui xing dan bai ,ji zhong AmDHN3.2Fwei jian xing dan bai ,AmDHN5.1F、AmDHN6.2Fhe AmDHN7.2wei suan xing dan bai ;li lun xiang dui fen zi zhi liang zui da de shi AmDHN7.2(21.42kD),zui xiao de shi AmDHN3.2F(10.69kD);li lun deng dian dian zui da de shi AmDHN3.2F(9.01),zui xiao de shi AmDHN6.2F(6.21)。dan bai er ji he san ji jie gou yu ce jie guo fa xian ,4chong dan bai jun you 3chong jie gou zu cheng :α-luo xuan (7.50%~32.63%)、mo gui ze juan qu (55.79%~73.00%)he yan shen lian (11.58%~19.50%)。cai yong lin jie fa gou jian ji tong jin hua shu ,bing jie ge tong yuan xiang shi xing fen xi fa xian ,4chong tuo shui su dan bai jun yu ji li mu xu Mt DHN3he ni na gai At DHN10qin yuan guan ji jiao jin 。li yong XSTREAMruan jian fen xi jie guo xian shi ,Am DHN5.1F、Am DHN6.2Fhe Am DHN7.2di 3ge dan bai xu lie ju you chuan lian chong fu chan yuan ,ju zhu yao ji zhong zai tuo shui su de zhong jian bu fen 。tong guo DOTTERruan jian sheng cheng dian zhen tu fa xian ,zai zhong jian ou yu cun zai da liang de duan pian duan chong fu ,shui ming tuo shui su xu lie de shou su huo kuo zhang zhu yao fa sheng zai zhong jian bu fen 。zhe xie yan jiu jie guo wei jin yi bu kai zhan sha dong qing DHNji yin jia zu de gong neng fen xi dian ding le ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物遗传资源学报的许洋,雷晨,佘露露,王瑾瑜,杨佳慧,陆雅宁,卢存福,陈玉珍,发表于刊物植物遗传资源学报2019年05期论文,是一篇关于脱水素论文,沙冬青论文,基因家族克隆论文,生物信息学论文,串联重复论文,植物遗传资源学报2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物遗传资源学报2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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