论文题目: CIDE-B基因的细胞特异性表达调控研究和LPTS基因区域转录调控元件S/MAR的研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 生物化学与分子生物学
作者: 答亮
导师: 赵慕钧,李载平
关键词: 细胞特异性表达,甲基化,细胞核骨架结合元件,染色质环
文献来源: 中国科学院研究生院（上海生命科学研究院）
发表年度: 2005
论文摘要: 本论文由两个部分组成:第一部分为细胞凋亡诱导因子CIDE-B基因表达调控研究;第二部分为LPTS基因区域核骨架结合元件(S/MAR)的检测、鉴定和功能研究。人CIDE-B蛋白是诱导细胞死亡的类似DFF45(Cell death-inducing DFF45-likeeffectors,CIDE)蛋白家族成员之一,其表达具有明显的组织和细胞特异性。我们对人CIDE-B基因细胞特异性表达的研究表明:CIDE-B基因具有长、短两个转录本,分别受到上游和内部两个启动子控制。CIDE-B基因两个转录本的表达都具有细胞特异性,其中,上游启动子区域的DNA甲基化情况决定了长转录本的细胞特异性表达;肝细胞核因子4α(HNF4α)结合并作用于内部启动子,对短转录本的细胞特异性表达起着重要调控作用。此外,转录因子Sp1和Sp3均能结合CIDE-B基因的两个启动子,并且调控它们的基本活性。我们的工作第一次深入研究了CIDE-B基因细胞特异性表达的调控机理,建立了从表观遗传和遗传水平双重调控基因表达的模型。核骨架结合元件(nuclear scaffold/matrix attachment region, S/MAR)是染色质环形成的结构基础,对于染色质水平基因表达调控起重要作用。人LPTS基因编码一个端粒酶抑制蛋白,是潜在的肝癌相关肿瘤抑制基因。我们对LPTS基因区域(162 kb)的S/MAR元件进行研究。检测并鉴定得到了5个具有核骨架蛋白结合能力的S/MAR,它们分别位于LPTS基因5’上游远端,intron 6,以及基因3’下游。其中,位于intron 6内的S/MAR Sα在稳定转染细胞中能增强下游报告基因的表达水平,并且这种增强作用具有方向性。我们的工作为进一步了解S/MAR在染色质结构和LPTS基因表达调控中的作用打下了基础。
论文目录:
序论
第一部分 细胞凋亡诱导因子CIDE-B 基因表达调控研究
中文摘要
英文摘要
前言
材料与方法
结果
1. CIDE-B 基因区域的基本结构分析
2. CIDE-B 基因细胞特异性表达的检测
3. CIDE-B 基因启动子的鉴定
3.1. CIDE-B 基因上游启动子鉴定
3.2. CIDE-B 基因内部启动子鉴定
4. Sp1/Sp3 调控 CIDE-B 基因启动子活性的研究
4.1. Sp1/Sp3 调控 CIDE-B 基因上游启动子活性
4.2. Sp1/Sp3 对 CIDE-B 基因内部启动子的作用
5. DNA 甲基化调控CIDE-B 基因细胞特异性表达的研究
5.1. 不同细胞中CIDE-B 基因上游启动子甲基化情况分析
5.2. DNA 甲基化抑制上游启动子活性
5.3. 5'-aza-dC 处理可激活CIDE-B 基因表达
6. 组织特异性转录因子调控CIDE-B 基因细胞特异性表达的研究
6.1. HNF4α对CIDE-B 基因表达的调控作用
6.2. PPARγ2 对CIDE-B 基因内部启动子的作用
讨论
结论
参考文献
第二部分 LPTS 基因区域核骨架结合元件(S/MAR)的检测、鉴定和功能研究
中文摘要
英文摘要
前言
材料与方法
结果
1. LPTS 基因区域 S
2. S/MAR 克隆库的复筛和验证
3. LPTS 基因区域 S
4. S/MAR 与核骨架蛋白的结合活性研究
5. S/MAR 特征序列分析研究
6. S/MAR 对真核基因表达调控的研究
讨论
结论
参考文献
论文和专利
致谢
发布时间: 2006-08-29
参考文献
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