东乡野生稻恢复基因QTL定位

论文摘要

开展野生稻恢复基因的研究有助于探索恢复基因的起源、细胞质与核间的相互作用,培育优良恢复系。本文选用栽培稻保持系协青早B为母本,东乡野生稻为父本,建立由239个株系组成的协青早B//协青早B/东乡野生稻BC1F10回交重组自交系群体。应用130对SSR标记构建遗传图谱,并利用协青早A/（协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10和中9A/（协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10两套测交群体对东乡恢复基因进行了QTL定位,主要结果如下:（1）应用协青早A/（协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10和中9A/（协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10两套测交群体对东乡野生稻恢复基因进行经典遗传学研究,结果表明:东乡野生稻对矮败型（CMS-DA）和印尼水田谷型（CMS-IA）不育系的育性恢复受主效恢复基因控制,同时还受微效恢复基因影响。（2）应用协青早B//协青早B/东乡野生稻BC1F10回交重组自交系群体,构建了由130个SSR标记组成的连锁遗传图谱。该图谱覆盖了水稻12条染色体,总图距为1530.8cM,标记间的平均距离为11.8cM。（3）利用WinQTLCart2.5软件对东乡野生稻恢复基因进行QTL分析,以LOD大于2.5为阈值,采用复合区间作图（CIM）法检测QTL。结果表明:1.在协青早A/（协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10群体中,仅在第10染色体RM304-RM171区间检测到一个QTL,其贡献率为10.0%。2.在中9A/ （协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10群体中在第1染色体RM10116-RM10176区间检测到一个QTL,其贡献率为8.2%;在第5染色体RM289-RM249区间和RM3870-RM274区间各检测到一个QTL,贡献分别为12.5%和6.5%;在第10染色体上RM1375-RM5620和RM304-RM171区间各检测到一个QTL,贡献率分别为4.8%和5.5%。（4）对东乡野生稻中控制协青早A和中9A的育性恢复QTL进行比较分析,结果表明:在第10染色体RM304-RM171区间都检测到一个QTL,位置基本一致;不同的是协青早A/（协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10群体中未检测到中9A/ （协青早B//协青早B/东乡野生稻）BC1F10群体中所存在的其它QTL。说明东乡野生稻具有对协青早A、中9A不育系育性恢复QTL,其育性恢复QTL数目、效应因不同群体、遗传背景而异。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 插图和附表清单
• 缩略词
• 1 文献综述
• 1.1 水稻恢复基因研究进展
• 1.1.1 水稻细胞质雄性不育性的类型
• 1.1.2 水稻恢复基因的来源
• 1.1.3 恢复基因的经典遗传学研究
• 1.1.4 恢复基因的定位
• 1.1.5 恢复基因的应用
• 1.2 东乡野生稻有利基因研究概况
• 1.2.1 东乡野生稻有利基因的研究现状
• 1.2.2 东乡野生稻恢复性研究
• 1.3 水稻分子标记概述
• 1.3.1 基于DNA 分子杂交为核心的分子标记
• 1.3.2 基于PCR 为核心的分子标记
• 1.3.3 基于PCR 与酶切相结合为核心的分子标记
• 1.3.4 基于单核苷酸多态性的DNA 标记
• 1.4 本论文研究内容的提出
• 2 材料与方法
• 2.1 材料
• 2.2 技术路线
• 2.3 表型鉴定
• 2.4 分子标记分析
• 2.4.1 DNA 提取
• 2.4.2 SSR 标记检测
• 2.5 数据分析
• 2.5.1 连锁图谱构建
• 2.5.2 QTL 检测
• 3 结果与分析
• 3.1 东乡野生稻经典遗传学研究
• 3.1.1 “协青早A/XD-BIL”测交群体育性遗传分析
• 3.1.2 “中9A/XD-BIL”测交群体育性遗传分析
• 3.1.3 “东野”一对或二对恢复基因的遗传模式
• 3.2 连锁图谱构建
• 3.2.1 多态性检测
• 3.2.2 连锁遗传图谱
• 3.3 恢复基因QTL 定位
• 3.3.1 协青早A/XD-BIL 测交群体中育性恢复QTL 检测
• 3.3.2 中9A/XD-BIL 测交群体中育性恢复QTL 检测
• 4 讨论
• 5 本论文主要结论
• 6 下一步工作设想
• 6.1 构建近等基因系
• 6.2 “东野”恢复基因QTL 精细定位与克隆
• 6.3 利用“东野”恢复基因改良恢复系前景
• 参考文献
• 附录
• 致谢
• 作者简历
• 在读期间公开发表论文（著）及科研情况