论文题目: 山羊促卵泡素和促黄体素基因部分序列的研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 动物遗传育种与繁殖
作者: 李利
导师: 吴登俊,邱祥聘
关键词: 山羊,基因,基因,系统发育,调控元件
文献来源: 四川农业大学
发表年度: 2005
论文摘要: 通过提高猪、牛、羊等家畜的产仔(羔)数以降低生产成本和增加经济效益是国内外的畜牧经营者和研究者的目标。在探索产仔(羔)数的影响因素方面已经发展到主基因水平。FSH和LH是促进卵泡的生长、发育、成熟和排卵必不可少的激素,同时它们还影响动物的生殖系统发育和雄性动物精子的生成。在猪的产仔数研究中已经将FSHβ基因的一个插入片段作为一个分子标记,但在山羊中只有FSHβ基因mRNA序列的报道。本研究参照GenBank中公布的牛、绵羊和猪等物种的FSHβ基因和LHβ基因序列,设计PCR引物,首次扩增并测定了21个家养山羊品种(中国地方品种15个,培育品种2个,引进品种4个)的FSHβ基因的两个内含子(内含子1和内含子2)和外显子3的部分序列以及LHβ基因的部分序列,研究它们的遗传结构,品种间、品种内的变异特征,并进一步利用序列分析物种间系统发育。 山羊FSHβ基因第一内含子DNA序列长度641bp,其平均的碱基组成为35.9%(A),13.9%(C),17.3%(G),32.9%(T);G+C(31.2%)的含量远低于A+T(68.8%)的含量。山羊群体的FSHβ基因intronl只有两个变异位点,分别位于71(A或G)和289(A或G)位。因此,从单倍型分析,共存在两种。安哥拉山羊(An)、辽宁绒山羊(L)、简阳本地羊(N)、乐至黑山羊(Lz)和奴比羊(Nb)这五个品种共享一种单倍型,其余15个品种共享另一种单倍型。 山羊FSHβ基因内含子2的全长1560bp,A、T、C、G四种碱基分别占总数的35.7%、32.8%、16.8%和14.8%,A+T的含量(68.5%)高于G+C含量(31.5%)。在所有测定个体中,共检测到14个碱基缺失和27个突变位点,单一信息位点7个,多态信息位点20个,其中19个两碱基变异位点,一个位点(890位A-G-T)发生三碱基变异。
论文目录:
中文摘要
英文摘要
第一章 文献综述
第一节 FSH和 LH的结构特点、分泌和分泌调控
一、FSH和LH的分子组成和结构
二、FSH和 LH的分泌及调控
第二节 FSH和 LH的功能及作用机理
一、FSH和 LH的功能
二、FSH、LH的作用机理
第三节 高繁殖力家畜在FSH和LH方面的变化
一、高繁殖力家畜血浆中有较高浓度的FSH和 LH
二、高繁殖力家畜的FSH/LH比值改变
三、发情到排卵前FSH、LH高峰的间隔增长
四、高繁殖力家畜对 FSH和 LH反应的敏感性高
第四节 FSHβ和LHβ基因的研究进展
一、FSHβ基因的研究进展
二、LHβ基因的研究进展
三、FSHβ基因与 LHβ基因的联系
第五节 本研究的选题背景及研究内容
第二章 材料与方法
一、材料来源
二、所用仪器和试剂
三、实验方法
四、数据处理
第三章 实验结果与分析
第一节 基因组 DNA抽提、FSHβ和 LHβ基因片段扩增及酶切
一、基因组 DNA的抽提结果
二、PCR扩增结果
三、LHβ基因扩增产物的RFLP分析
第二节 山羊 FSHβ第一内含子序列分析
一、山羊 FSHβ基因内含子1序列分析
二、物种间FSHβ基因intron1序列比较
第三节 山羊FSHβ基因第二内含子序列结果及分析
一、山羊FSHβ基因intron2序列变异分析
二、不同物种FSHβ intron2序列的比较分析
第四节 FSHβ基因外显子3部分序列的结果及分析
一、山羊 FSHβ基因第三外显子部分序列的变异分析
二、不同山羊品种FSHβ基因外显子3编码的氨基酸序列分析
三、山羊的FSHβ基因外显子3编码区与其它物种的比较
第五节 山羊LHβ基因序列分析
一、山羊 LHv基因碱基变异分析
二、山羊LHβ基因5’非翻译区的转录调控元件分析
三、LHβ基因编码的氨基酸组成和密码子使用情况分析
四、山羊LHβ基因编码区与其它物种之间的比较分析
五、南江黄羊群体LHβ基因扩增产物的多态性分析
第六节 FSHβ基因和LHβ基因的系统发育分析
一、FSHβ基因序列的分子系统发育分析
二、LHβ基因序列的系统发育分析
第四章 讨论
第一节 山羊FSHβ基因和LHβ基因序列特点
一、山羊 FSHβ基因序列特点
二、山羊LHβ基因序列的特点
三、山羊FSHβ基因和LHβ基因密码子使用的偏倚性
第二节 山羊FSHβ基因和LHβ基因与繁殖性能的关系
一、各山羊品种的产羔率与FSHβ基因和LHβ基因突变的关系
二、LHβ基因的酶切多态性与繁殖性能
第三节 山羊的遗传多样性、遗传分化和分子进化
一、山羊的遗传多样性
二、山羊品种间的遗传分化
三、核功能基因与物种进化分析
第四节 影响FSHβ基因和LHβ基因实验研究的因素
一、引物
二、PCR扩增条件的选择和优化
三、目的DNA片段的回收
第五章 结论
参考文献
致谢
附录
攻读博士学位期间发表的论文及取得的成果
附表1 山羊FSHβ intron2 的突变位点
附表2 山羊FSHβ exon3编码的氨基酸序列比较
附表3 山羊的FSHβ exon3编码序列的同义替换和非同义替换
附表4 本实验测定的有关序列NCBI索引号
附图1 南江黄羊103#个体FSHβintron1测序胶图
附图2 南江黄羊7#个体FSHβ intron2测序胶图
附图3 南江黄羊7#个体FSHβexon3测序胶图
附图4 南江黄羊138#个体LHβ基因序列测定胶图
发布时间: 2005-10-27
参考文献
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