人Tim-3启动子的克隆及其逆转录病毒表达载体的构建

人Tim-3启动子的克隆及其逆转录病毒表达载体的构建

论文摘要

Tim-3(T-cell immunoglobulin-and mucin-domain-containing molecule-3,T细胞免疫球蛋白粘蛋白分子-3)是新近发现的免疫调节分子,特异表达于分化的Th1细胞,参与Th1负调控和免疫耐受形成,在多种免疫性疾病发生中发挥重要作用,阻断其表达可缓解Th2应答引起的过敏性疾病,是多种免疫性疾病的潜在治疗靶标,引起国内外学者广泛关注。但Tim-3研究尚存在诸多问题未能解决,尤其是其表达调控机制研究尚属空白。本研究分三部分内容:初步研究正常人PBMC Tim-3的表达模式;克隆具有特异启动子活性的基因片段,构建人Tim-3启动子报告质粒;构建人Tim-3逆转录病毒表达载体,为进一步研究Tim-3表达调控机制及探索利用Tim-3进行疾病治疗的可行性奠定基础。第一部分正常人PBMC Tim-3表达模式的初步研究研究目的检测经丝裂原刺激的人外周血淋巴细胞Tim-3的表达情况,为进一步研究Tim-3表达调控机制提供实验模型。研究方法分离人PBMC,贴壁法去除单核细胞后,分别以PHA、LPS刺激悬浮的淋巴细胞,24h后抽提细胞总RNA,RT-PCR检测Tim-3的表达。未刺激淋巴细胞作对照。研究结果RT-PCR检测显示PHA刺激的人外周血淋巴细胞Tim-3表达上调,而LPS刺激的不表达Tim-3,提示处于活化、非极化的T细胞就开始表达该分子。结论及意义本部分建立了可供作为研究Tim-3表达调控的细胞模型,为进一步深入研究Tim-3表达调控机制提供实验基础。第二部分人Tim-3启动子的克隆及其活性的初步研究研究目的构建人Tim-3启动子萤火虫荧光素酶报告质粒并分析其活性,为进一步研究Tim-3特异表达于Th1细胞的分子机制奠定基础。研究方法1人Tim-3启动子区的预测利用在线MatInspector软件对人Tim-3基因5′端-2500~+202段进行启动子区预测。2 Tim-3P1与Tim-3P2 PCR扩增选定长2325bp的-2083~+242段,并依据该段单一SacⅠ酶切位点,分Tim-3P1(-2083~-838)和Tim-3P2(-948~+242)两部分克隆。设计针对Tim-3P1和Tim-3P2的特异性引物,以人基因组DNA为模板进行PCR扩增。3含不同长度人Tim-3基因5′端片段报告质粒的构建及鉴定Tim-3P1 PCR产物,T-A克隆入pGEM-T,测序正确后,亚克隆入pGL3-Basic相应酶切位点构建pGL3-Tim-3P1。Tim-3P2 PCR产物,经SacⅠ、XhoⅠ双酶切、回收后,插入pGL3-Basic多克隆位点(MCS)构建pGL3-Tim-3P2。亦经测序鉴定。为增强所构建报告质粒的启动子活性,设计在上述阳性pGL3-Tim-3P2中引入SV40增强子序列构建Enhancer-Tim-3P2,经双酶切鉴定。4 RT-PCR检测细胞系内源性Tim-3的表达收集对数生长期RAW264.7、B16及COS-75×105,Trizol法抽提细胞总RNA并行RT-PCR检测。5报告质粒的转染将上述构建的报告质粒及pGL3-Basic(阴性对照)分别与pRL-TK(内参照)瞬时共转染RAW264.7、B16和COS-7(详见附图表第二部分),48h收集细胞,对细胞粗提液进行双荧光素酶分析。6双荧光素酶分析按双荧光素酶报告基因检测试剂盒说明书将细胞裂解后与底物混合,用荧光计数仪检测所构建报告质粒中萤火虫荧光素酶活性M1与pRL-TK中海肾荧光素酶活性M2,M1/M2的比值即为目的片段的相对活性。每种质粒设2复孔,同一转染实验至少重复3次。7 Tim-3P1与Tim-3P2转录因子结合位点(TFBSs)分析同样利用在线MatInspector软件分析Tim-3P1与Tim-3P2中可能存在的TFBSs。研究结果1人Tim-3启动子区的预测分析显示-2500~+202段存在多个TATA box、CAAT box及多个重要TFBSs,可能具有启动子活性。2成功构建人Tim-3启动子萤火虫荧光素酶报告质粒测序鉴定证实pGL3-Tim-3P1、pGL3-Tim-3P2构建成功;酶切鉴定证实Enhancer-Tim-3P2构建成功。3不同细胞系内源性Tim-3的表达RT-PCR检测显示RAW264.7和B16表达内源性Tim-3,而COS-7不表达。4报告质粒启动子活性的验证双荧光素酶分析证实pGL3-Tim-3P1与pGL3-Tim-3P2均具有较弱的启动子活性,其中,pGL3-Tim-3P2相对活性约是pGL3-Basic空载体的2倍,且启动子活性具有细胞特异性;引入增强子的Enhancer-Tim-3P2启动子活性明显升高。5 TFBSs分析结果显示Tim-3P1含有下列TFBSs:①1个c-Myb、Ik-1、YY1(Yin and Yang 1,阴阳1)、GATA-3(GATA-binding factor-3)和CHOP;②2个FOXK2、HNF-3(hepatocyte nuclear factor-3,肝细胞核因子-3);③6个TATA box;Tim-3P2含有下列TFBSs:①1个RFX1、p53、GATA-3、NFAT(Nuclear factor of activated T cells,活化T细胞核因子)和CDE/CHR(cell cycle-dependentelement,细胞周期依赖性元件;cell cycle genes homology region,细胞周期基因同源区);②2个MZF1(Myeloid zinc finger protein-1);③3个YY1;④5个TATA box。结论及意义本部分成功构建了含人Tim-3启动子的萤火虫荧光素酶报告质粒和带有增强子序列的报告质粒,为进一步研究Tim-3表达调控机制奠定了基础。鉴于Tim-3在免疫应答中的重要作用,深入研究其表达调控将具有重要的理论意义和良好的应用前景。第三部分人Tim-3逆转录病毒表达载体的构建研究目的构建人Tim-3逆转录病毒表达载体,为进一步研究Tim-3表达调控机制、探索利用Tim-3治疗疾病的可行性奠定基础。研究方法设计针对人Tim-3 mRNA的特异性引物,以hTim-3-pGEM-T为模板进行PCR扩增。产物克隆入逆转录病毒表达载体pLNCX2的HindⅢ、NotⅠ位点,构建pLNCX2-Tim-3。经PCR、酶切及测序鉴定正确后,转染PT67细胞,48h抽提总RNA并RT-PCR检测Tim-3的表达。PT67空细胞和pLNCX2空载体转染的PT67细胞作对照。研究结果PCR、酶切及测序鉴定证实重组载体pLNCX2-Tim-3构建成功;RT-PCR显示pLNCX2-Tim-3在包装细胞PT67中可有效表达Tim-3。结论及意义成功构建了有效表达人Tim-3的逆转录病毒表达载体,为进一步研究Tim-3表达调控机制及探索Tim-3过表达治疗疾病的可行性奠定基础。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 符号说明
  • 总前言
  • 第一部分 正常人PBMC TIM-3表达模式的初步研究
  • 技术路线
  • 1 材料
  • 2 方法
  • 2.1 Ficoll法分离人PBMC
  • 2.2 人PBMC培养及刺激
  • 2.3 Trizol法抽提细胞总RNA
  • 2.4 RT-PCR检测Tim-3的表达
  • 3 结果
  • 4 讨论
  • 第二部分 人TIM-3启动子的克隆及其活性的初步研究
  • 技术路线
  • 1 材料
  • 2 方法
  • 2.1 含有不同长度人Tim-3启动子报告质粒的构建及鉴定
  • 2.2 报告质粒Tim-3启动子活性的验证
  • 3 结果
  • 3.1 成功构建含不同长度人Tim-3启动子的报告质粒
  • 3.2 报告质粒Tim-3启动子活性的验证
  • 4 讨论
  • 附图表第二部分
  • 第三部分 人TIM-3逆转录病毒表达载体的构建
  • 技术路线
  • 1 材料
  • 2 方法
  • 2.1 重组质粒pLNCX2-Tim-3的构建及鉴定
  • 2.2 RT-PCR检测构建载体Tim-3的表达
  • 3 结果
  • 3.1 成功构建重组质粒pLNCX2-Tim-3
  • 3.2 RT-PCR检测构建载体Tim-3的表达
  • 4 讨论
  • 小结
  • 参考文献
  • 附录一 质粒物理图谱
  • 附录二 实验工具
  • 附录三 常用实验步骤
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文目录
  • 学位论文评阅及答辩情况表
  • 相关论文文献

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