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Apn、MDH和IGF-Ⅰ基因对京海黄鸡重要经济性状的遗传效应研究

2020-12-07阅读(960)

Apn、MDH和IGF-Ⅰ基因对京海黄鸡重要经济性状的遗传效应研究

论文摘要

本试验用PCR-SSCP和RFLP方法检测京海黄鸡Apn, MDH和IGF-Ⅰ基因的SNP。系统研究脂联素（Adiponectin, Apn）,苹果酸脱氢酶（Malate Dehydrogenase,MDH）和类胰岛素生长因子（Insulin-like growth factor-Ⅰ, IGF-Ⅰ）基因SNP,并与京海黄鸡的生长性状、繁殖性状、屠宰性状和肉品质性状进行联合分析,为京海黄鸡早期生长分子标记辅助选择提供有效的遗传标记。研究结果如下：1.京海黄鸡Apn基因的部分5′侧翼区和编码区进行了分子遗传学研究,发现的SNP有：C1251G, C1608T, G1773A, A1782G, T1902C, G1993C和G2013A。Apn基因的7个SNP中有5个处在编码区,但都是同义突变,这5个碱基的突变未能导致氨基酸的改变。MDH基因253位置检测到T→C的突变。IFG-Ⅰ基因在SSCP筛查时发现引物P11具有多态性,是由两个A的插入引起的。2.京海黄鸡中检测到的AD2、AD7、MD和P11座位都属于中度多态（0.50>PIC>0.25）位点,AD5和AD6座位属于高度多态（PIC>0.50）位点。3.京海黄鸡Apn基因AD2座位AA基因型个体开产日龄显著小于AB基因型个体（P<0.05）,AA基因型个体的300日龄产蛋数也显著高于AB基因型的个体（P<0.05）；AD5座位h3h5基因型个体的开产日龄极显著低于hlhl基因型的个体（P<0.01）,京海黄鸡h3h5基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于hlhl基因型的个体（P<0.05）；AD6座位h2h5基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著（P<0.05）或极显著（P<0.01）高于hlh5基因型的个体；AD7座位GG基因型个体的开产日龄显著小于AA基因型的个体（P<0.05）,GG基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著大于AA基因型个体（P<0.05）。Apn基因不同座位对产蛋性状的主效应指数都很小,推测Apn基因可能与影响产蛋性状的主效基因连锁。4.京海黄鸡Apn基因AD2、AD5和AD6基因座对京海黄鸡脂肪沉积有显著效应,且性别效应明显：公鸡群体中AD2座位BB基因型个体的腹脂重和腹脂率显著高于AA型个体的腹脂重和腹脂率（P<0.05）,在母鸡群体中,BB基因型个体的腹脂率显著高于AA基因型个体（P<0.05）；AD2座位BB基因型对腹脂率的贡献率达到30%。在母鸡群体中,AD5座位hlh3基因型个体的腹脂重和腹脂率最大,极显著高于h2h3.基因型个体均值（P<0.01）,hlh3基因型对母鸡的腹脂重和腹脂率的贡献率分别为48.71%和12.72%。AD6座位h3h4基因型和h2h5基因型个体的腹脂重和腹脂率显著高于h2h3型个体（P<0.05）。AD6座位h3h4基因型对母鸡的腹脂重和腹脂率的贡献率为40.98%和10.99%,h2h5型分别为18.68%和32.93%。5.京海黄鸡MDH基因BB基因型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数极显著低于AA基因型和AB基因型个体（P<0.01）。BB基因型个体的腹脂重和腹脂率均最低,与AA基因型个体差异显著（P<0.05）。BB基因型是降低腹脂性状的优势基因,BB基因型对腹脂重和腹脂率的遗传贡献率在公鸡群体中为-24.18%和-30.18%,在母鸡群体中为-33.65%和-18.24%。MDH基因对京海黄鸡的腿肌重有明显效应。推测MDH基因可能是影响鸡脂肪性状和繁殖性状的主效基因或与控制脂肪性状和繁殖性状的主效基因相连锁。6.IGF-Ⅰ基因引物P11检测的多态性对京海黄鸡脚重有极显著影响,DD基因型个体的脚重显著高于CC型个体。该基因座对京海黄鸡公母鸡的脚重MEI都大于11%。7.京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因两两或三者对初生重的互作效应显著（P<0.05）或极显著（P<0.01）。京海黄鸡Apn基因和IGF-Ⅰ基因对开产日龄和300日龄产蛋数互作效应显著（P<0.05）。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 文献综述
  • 1. 鸡分子遗传标记
  • 1.1 SSR
  • 1.1.1 SSR的基本概念及特征
  • 1.1.2 SSR的分布和组成
  • 1.1.3 SSR的检测技术
  • 1.2 SNP
  • 1.2.1 SNP的基本概念和特点
  • 1.2.2 SNP的检测技术
  • 1.2.2.1 酶或PCR为基础的检测方法
  • 1.2.2.2 以杂交为基础的SNP检测方法
  • 1.2.2.3 以构象为基础的方法
  • 2. 鸡脂肪沉积的研究概况
  • 2.1 鸡体脂的沉积原理
  • 2.2 鸡体脂的定位情况
  • 2.3 影响脂肪沉积的基因
  • 3. MDH研究进展
  • 3.1 MDH概述
  • 3.2 MDH结构
  • 3.3 MDH功能
  • 3.4 MDH表达
  • 3.5 MDH基因与动物代谢
  • 4. Apn的研究进展
  • 4.1 Apn的结构
  • 4.2 Apn对糖、脂代谢的调控作用
  • 4.3 Apn的生物学作用
  • 4.4 Apn在动物上的研究进展
  • 5. IGF-Ⅰ的研究进展
  • 5.1 IGF-Ⅰ的结构
  • 5.2 IGF-Ⅰ的生物学作用
  • 5.2.1 IGF-Ⅰ与生长发育
  • 5.2.2 IGF-Ⅰ与蛋白代谢
  • 5.2.3 IGF-Ⅰ与脂代谢
  • 5.2.4 IGF-Ⅰ与矿物质代谢
  • 5.2.5 IGF-Ⅰ与繁殖
  • 5.3 IGF-Ⅰ基因与生产性状相关的多态性研究
  • 6. 京海黄鸡
  • 7. 研究的目的和意义
  • 第二章 材料和方法
  • 1 材料
  • 1.1 试验动物及样本的收集
  • 1.2 主要仪器和试剂
  • 2 实验方法
  • 2.1 屠宰性能测定
  • 2.2 肉质测定
  • 2.3 基因组DNA的提取与检测
  • 2.4 统计分析及引物设计软件
  • 2.5 PCR-SSCP检测
  • 2.5.1 引物设计
  • 2.5.2 引物的合成与稀释
  • 2.5.3 最佳PCR反应条件和反应体系的建立
  • 2.5.4 扩增产物SSCP检测
  • 2.5.5 扩增产物RFLP检测
  • 2.5.6 产物测序
  • 2.6 数据分析
  • 2.6.1 等位基因频率和基因型频率
  • 2.6.2 卡方适合性检验
  • 2.6.3 遗传多态性分析
  • 2.6.4 统计分析模型与软件
  • 2.6.5 基因型对性状贡献率与基因主效应指数
  • 第三章 结果和分析
  • 1. 基因组DNA提取结果
  • 2. 京海黄鸡Apn基因序列遗传效应分析
  • 2.1 Apn基因序列遗传多态性分析
  • 2.1.1 Apn基因不同引物的扩增结果
  • 2.1.2 Apn基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定
  • 2.1.3 京海黄鸡Apn基因遗传变异与PCR-SSCP多态性检测结果
  • 2.1.4 京海黄鸡Apn基因氨基酸序列分析
  • 2.1.5 京海黄鸡Apn基因群体遗传学分析
  • 2.2 Apn基因PCR-SSCP多态性与经济性状的关联分析
  • 2.2.1 Apn基因AD2座位不同基因型与经济性状的关联分析
  • 2.2.2 Apn基因AD5座位不同基因型与经济性状的关联分析
  • 2.2.3 Apn基因AD6座位不同基因型与经济性状的关联分析
  • 2.2.4 Apn基因AD7座位不同基因型与经济性状的关联分析
  • 2.3 京海黄鸡Apn基因SNP不同基因型对经济性状的贡献率分析
  • 2.3.1 京海黄鸡Apn基因SNP不同基因型对生长性状的贡献率
  • 2.3.2 京海黄鸡Apn基因SNP不同基因型对繁殖性状的贡献率
  • 2.3.3 京海黄鸡Apn基因不同基因型对屠宰性状的贡献率
  • 2.3.4 京海黄鸡Apn基因不同基因型对肉质性状的贡献率
  • 2.4 京海黄鸡Apn基因不同基因座对经济性状的主效应指数分析
  • 3. 京海黄鸡MD基因序列遗传效应分析
  • 3.1 MD基因序列遗传多态性分析
  • 3.1.1 MDH基因不同引物的扩增结果
  • 3.1.2 MDH基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定
  • 3.1.3 京海黄鸡MDH基因遗传变异与PCR-RFLP多态性检测结果
  • 3.1.4 京海黄鸡MDH基因群体遗传变异分析
  • 3.2 MDH基因PCR-RFLP多态性与经济性状的关联分析
  • 3.2.1 MDH基因不同基因型与生长性状的关联分析
  • 3.2.2 MDH基因不同基因型与繁殖性状的关联分析
  • 3.2.3 MDH基因不同基因型与屠宰和肉质性状的关联分析
  • 3.3 MDH基因不同基因型对经济性状的贡献度和主效应指数分析
  • 3.3.1 京海黄鸡MDH基因不同基因型对经济性状的贡献度
  • 3.3.2 京海黄鸡MDH基因对经济性状的主效应指数分析
  • 4. 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因序列遗传效应分析
  • 4.1 IGF-Ⅰ基因序列遗传多态性分析
  • 4.1.1 IGF-Ⅰ基因不同引物的扩增结果
  • 4.1.2 IGF-Ⅰ基因不同引物所分离基因片段的序列分析与鉴定
  • 4.1.3 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因遗传变异与PCR-SSCP多态性检测结果
  • 4.1.4 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因群体遗传学分析
  • 4.2 IGF-Ⅰ基因PCR-SSCP多态性与经济性状的关联分析
  • 4.3 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因基因不同基因型对经济性状的贡献度和主效应指数分析
  • 4.3.1 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因不同基因型对经济性状的贡献度
  • 4.3.2 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因不同基因型对经济性状的主效应指数分析
  • 5. 京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对经济性状的互作效应
  • 5.1 京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对生长性状的互作效应
  • 5.2 京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对繁殖性状的互作效应
  • 5.3 京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对屠宰性状的互作效应
  • 5.4 京海黄鸡Apn、MDH与IGF-Ⅰ基因对肉质性状的互作效应
  • 第四章 讨论
  • 1. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因多态性
  • 1.1 PCR-SSCP用于Apn基因和IGF-Ⅰ基因多态性
  • 1.2 PCR-RFLP用于MDH基因多态性检测
  • 1.3 SNP
  • 2. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因群体遗传分析
  • 3. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因多态性与经济性状的关联
  • 3.1 京海黄鸡Apn基因多态性与经济性状的关联
  • 3.1.1 京海黄鸡Apn基因多态性与生长性状的关联分析
  • 3.1.2 京海黄鸡Apn基因多态性与繁殖性状的关联分析
  • 3.1.3 京海黄鸡Apn基因多态性与屠宰性状的关联分析
  • 3.2 京海黄鸡MDH基因多态性与经济性状的关联
  • 3.3 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因多态性与经济性状的关联
  • 4. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因贡献率
  • 4.1 京海黄鸡Apn基因贡献率
  • 4.2 京海黄鸡MDH基因贡献率
  • 5. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因对经济性状主效应指数
  • 5.1 京海黄鸡Apn基因对经济性状的主效应指数
  • 5.2 京海黄鸡MDH基因对经济性状的主效应指数
  • 5.3 京海黄鸡IGF-Ⅰ基因对经济性状的主效应指数
  • 6. 京海黄鸡Apn基因、MDH基因和IGF-Ⅰ基因对经济性状的互作效应
  • 第五章 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的论文

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    • [9].APN技术在地震前兆观测系统中的应用[J]. 自动化与仪表 2010(10)
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    • [16].APN连续排班层级管理模式在骨科病房中的应用研究[J]. 护士进修杂志 2010(10)
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