日粮中添加稻谷及不同形态糙米、稻壳对鹅肠道微生物区系的影响

论文摘要

本试验以4-10周龄扬州鹅为研究对象,运用PCR-DGGE分子技术和现代营养学实验手段,旨在研究稻谷替代标准日粮中部分玉米、以及稻谷各成分（稻壳和糙米）的不同形态,对鹅肠道细菌群落结构和多样性以及鹅盲肠挥发性脂肪酸、盲肠组织形态学的影响。试验一选用4周龄扬州鹅公鹅64只,随机分为2组,每组4个重复,每个重复8只。在营养水平基本一致的情况下,一组饲喂玉米-豆粕型日粮,另一组作为试验组,饲喂玉米-稻谷-豆粕型日粮。试验二选取4周龄扬州公鹅128只,随机分为4组,每组4个重复,每个重复8只；饲喂的日粮组成及营养水平相同,日粮中仅原料中糙米和稻壳的粒度不同；四个处理分别为：A（整粒糙米-粉碎稻壳）、B（整粒糙米-整粒稻壳）、C（粉碎糙米-粉碎稻壳）、D（粉碎糙米-整粒稻壳）。两试验试验期均为42天。结果表明：1.本试验以分子生物学方法提取的肠道微生物总DNA平行样,PCR-DGGE图谱条带数量和迁移率基本一致,克服传统细菌培养方法结果不稳定的缺点。2.空肠不同部位之间（前、中、后）肠道微生物区系之间存在着一定差异。由相似性指数可知,空肠间的差异大于空肠与十二指肠的差异（72.2%-85.7%<95.0%）,但是要小于空肠与回肠之间的差异（72.2%-85.7%>54.6%）。3.日粮中添加稻谷能够影响鹅肠道微生物菌群的分布,可导致十二指肠（21：15）、空肠（19：14）细菌种类的增加和直肠（22：30）菌群种类的下降；相对于十二指肠,空肠内共有菌群比率上升；日粮中添加稻谷对肠道后段的回肠菌群相似性指数的影响最大,对盲肠微生物区系影响最小4.整粒糙米-整粒稻壳处理组的鹅肠道菌群种类最少,整粒日粮能够导致肠道菌群种类下降；整粒糙米、整粒稻壳对鹅的回肠肠道微生物区系影响最大,对盲肠微生物区系的影响最小,其中整理糙米有增加空肠处菌群种类的趋势,全粉日粮导致直肠菌群下降。5.相对于糙米粒度的影响,稻壳粒度对肠道微生物的影响较小,糙米粉碎更能够对肠道微生物区系产生影响；整粒糙米和整粒稻壳的互作效应对肠道菌群的影响次序是：回肠>空肠>十二指肠>盲肠、直肠。6.糙米和稻壳粒度对鹅盲肠挥发性脂肪酸的影响较小,说明糙米和稻壳粒度不会影响鹅盲肠微生物的厌氧发酵；本试验得出鹅盲肠VFA中乙酸、丙酸、丁酸比例约为10：2：1。7.糙米、稻壳不同粒度对鹅盲肠组织形态产生一定影响,整粒糙米和整粒稻壳会极显著增加盲肠绒毛高度（P<0.01）,同时使隐窝深度显著加深（P<0.05）,而对V/C影响差异不显著（P>0.05）；整粒糙米能显著增加绒毛宽度（P<0.05）；互作效应结果显示,相比于稻壳粉碎与否,糙米粉碎与否对盲肠组织形态影响较大。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 1 家禽肠道微生物区系的研究进展
• 1.1 肠道微生物在动物肠道中的作用
• 1.2 DGGE技术在动物肠道微生物区系上的应用
• 1.2.1 DGGE技术
• 1.2.2 DGGE在动物肠道微生物上的应用
• 2 日粮营养成分与粒度对单胃动物肠道微生物和盲肠黏膜的影响
• 2.1 日粮成分对单胃动物肠道微生物区系的影响
• 2.2 日粮粒度对单胃动物微生物区系和盲肠消化道发育的影响
• 3 稻谷型日粮和日粮粒度在家禽上的研究现状
• 3.1 稻谷型日粮在家禽上的研究现状
• 3.1.1 稻谷的各组成部分营养价值
• 3.1.2 稻谷型日粮在家禽上的应用研究
• 3.2 日粮不同粒度处理在家禽上应用
• 3.2.1 日粮粒度在家禽上的研究
• 3.2.2 稻谷的各组成部分的粒度处理
• 4 研究意义
• 第二章 日粮中添加稻谷对鹅肠道微生物区系的影响
• 1 材料与方法
• 1.1 试验设计及饲养管理
• 1.2 试验日粮
• 1.3 样品的采集
• 1.4 肠道微生物总DNA提取
• 1.5 总DNA的浓度和纯度检测
• 1.6 PCR扩增和产物的检测
• 1.7 变性梯度凝胶电泳（DGGE）
• 1.8 数据分析
• 2 试验仪器和试剂
• 2.1 主要仪器和器具
• 2.2 主要试剂及配制方法
• 3 结果与分析
• 3.1 肠道微生物总DNA的提取结果
• 3.2 肠道微生物总DNA的PCR扩增
• 3.3 同组样品DNA平行样DGGE图谱结果
• 3.4 空肠不同肠段微生物区系的DGGE图谱分析
• 3.5 日粮中添加稻谷对鹅肠道菌群结构的影响
• 4 讨论
• 4.1 同组样品DNA平行样DGGE
• 4.2 空肠不同肠段的微生物区系
• 4.3 日粮中添加稻谷对鹅肠道微生物区系的影响
• 5 小结
• 第三章 不同形态糙米、稻壳对鹅肠道微生物区系、盲肠VFA和盲肠组织形态的影响
• 1 材料与方法
• 1.1 试验动物与试验设计
• 1.2 试验日粮
• 1.3 样品的采集
• 1.4 试验方法和测量指标
• 1.4.1 16S rDNA片段V3区的DGGE检测和分析
• 1.4.2 盲肠肠道VFA的测量
• 1.4.3 盲肠组织形态测量
• 1.5 数据处理
• 2 结果与分析
• 2.1 5个肠段16S rDNA片段V3区的PCR扩增
• 2.2 不同形态糙米、稻壳对鹅不同肠道菌群的影响
• 2.3 不同形态糙米、稻壳对鹅不同肠道菌群数量的影响
• 2.4 鹅肠道微生物电泳图谱聚类分析和菌群相似性分析
• 2.5 不同形态糙米、稻壳对鹅盲肠VFA的影响
• 2.6 不同形态糙米、稻壳对鹅盲肠组织形态的影响
• 3 讨论
• 3.1 不同形态糙米、稻壳对鹅不同肠段菌群数量的影响
• 3.2 整粒糙米、稻壳及其互作效应对鹅相同肠段微生物区系的影响
• 3.3 不同形态糙米、稻壳对鹅盲肠VFA的影响
• 3.4 不同形态糙米、稻壳对鹅盲肠组织形态的影响
• 4 小结
• 全文结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文目录
• 附录：肠道组织切片软件视图