黄嘉禾:一类广义迭代图形表示在蛋白质序列分析中的应用论文

黄嘉禾:一类广义迭代图形表示在蛋白质序列分析中的应用论文

本文主要研究内容

作者黄嘉禾(2019)在《一类广义迭代图形表示在蛋白质序列分析中的应用》一文中研究指出:构建计算模型分析海量的蛋白序列数据并实现其信息的准确识别是生物信息学领域研究中的重点问题。这里数据的定量描述和模型构建是蛋白序列分析的关键。蛋白序列图形表示方法拥有计算简单、易数值刻画和可用于处理大量数据等优点,自提出以来备受研究者们的关注。迭代函数构造是蛋白序列图形表示中的重要一环。通过将蛋白质图形表示中的迭代函数推广到高维空间,本论文提出了一种适用范围更加广泛的广义迭代函数。应用该广义迭代函数和氨基酸残基的某些理化指标,得到了一类新的蛋白质序列图形表示方法并对所得到的图形进行数值刻画,从而得到了新的蛋白质序列的相似性分析方法。利用本文的方法,分别比较10种物种ND5蛋白序列与ND6蛋白序列的相似性并构建了它们之间的进化树。将本文方法所得结果与ClustalW方法得到的结果逐一进行相关性分析。分析结果显示,本文所得结果与ClustalW方法得到的结果具有较高的相关性。进一步地,本文利用提出的蛋白质序列图形表示方法,构造了一种基于多种氨基酸残基理化指标的高维广义迭代函数模型。采用矩阵的奇异值分解方法对其进行数值刻画,并将此方法应用于蛋白质亚细胞定位预测中。运用BP神经网络算法,对蛋白质数据集CL317进行预测,取得95.31%的总体预测精度。这些结果表明,本文所提出的方法具有一定的有效性和可靠性。

Abstract

gou jian ji suan mo xing fen xi hai liang de dan bai xu lie shu ju bing shi xian ji xin xi de zhun que shi bie shi sheng wu xin xi xue ling yu yan jiu zhong de chong dian wen ti 。zhe li shu ju de ding liang miao shu he mo xing gou jian shi dan bai xu lie fen xi de guan jian 。dan bai xu lie tu xing biao shi fang fa yong you ji suan jian chan 、yi shu zhi ke hua he ke yong yu chu li da liang shu ju deng you dian ,zi di chu yi lai bei shou yan jiu zhe men de guan zhu 。die dai han shu gou zao shi dan bai xu lie tu xing biao shi zhong de chong yao yi huan 。tong guo jiang dan bai zhi tu xing biao shi zhong de die dai han shu tui an dao gao wei kong jian ,ben lun wen di chu le yi chong kuo yong fan wei geng jia an fan de an yi die dai han shu 。ying yong gai an yi die dai han shu he an ji suan can ji de mou xie li hua zhi biao ,de dao le yi lei xin de dan bai zhi xu lie tu xing biao shi fang fa bing dui suo de dao de tu xing jin hang shu zhi ke hua ,cong er de dao le xin de dan bai zhi xu lie de xiang shi xing fen xi fang fa 。li yong ben wen de fang fa ,fen bie bi jiao 10chong wu chong ND5dan bai xu lie yu ND6dan bai xu lie de xiang shi xing bing gou jian le ta men zhi jian de jin hua shu 。jiang ben wen fang fa suo de jie guo yu ClustalWfang fa de dao de jie guo zhu yi jin hang xiang guan xing fen xi 。fen xi jie guo xian shi ,ben wen suo de jie guo yu ClustalWfang fa de dao de jie guo ju you jiao gao de xiang guan xing 。jin yi bu de ,ben wen li yong di chu de dan bai zhi xu lie tu xing biao shi fang fa ,gou zao le yi chong ji yu duo chong an ji suan can ji li hua zhi biao de gao wei an yi die dai han shu mo xing 。cai yong ju zhen de ji yi zhi fen jie fang fa dui ji jin hang shu zhi ke hua ,bing jiang ci fang fa ying yong yu dan bai zhi ya xi bao ding wei yu ce zhong 。yun yong BPshen jing wang lao suan fa ,dui dan bai zhi shu ju ji CL317jin hang yu ce ,qu de 95.31%de zong ti yu ce jing du 。zhe xie jie guo biao ming ,ben wen suo di chu de fang fa ju you yi ding de you xiao xing he ke kao xing 。

论文参考文献

  • [1].基于多核学习的蛋白质序列分类问题的研究与应用[D]. 连秋雨.电子科技大学2019
  • [2].蛋白质序列信息提取方法及亚细胞定位预测研究[D]. 刘清华.云南大学2018
  • [3].蛋白质亚细胞定位预测研究[D]. 赵南.南京农业大学2017
  • [4].氨基酸的分布式表示方法及其在蛋白质序列分析中应用[D]. 何柳.吉林大学2019
  • [5].基于位置序列的蛋白质序列相似性分析及其应用[D]. 王磊.西北农林科技大学2018
  • [6].蛋白质序列的相似性比较及聚类的数学方法[D]. 王华.大连交通大学2018
  • [7].基于深度学习的蛋白质序列分类问题的研究与应用[D]. 邵丽芬.电子科技大学2018
  • [8].基于集成学习的蛋白质序列分类问题的研究[D]. 赵欣.电子科技大学2018
  • [9].基于氨基酸理化性质和位置特征的蛋白质序列比较及其应用[D]. 于璐璐.山东大学2018
  • [10].蛋白质序列的数值特征提取方法与应用[D]. 宋田.燕山大学2017
  • 读者推荐
  • [1].基于胜任力模型的SH公司班组长培训体系改进研究[D]. 刘梦雨.内蒙古大学2019
  • [2].大跨度钢管混凝土拱桥施工监控关键技术研究[D]. 黄庆业.浙江理工大学2019
  • [3].基于“红妆”文化的斯宅村落空间景观设计实践研究[D]. 唐纪成.浙江理工大学2019
  • [4].基于物联网技术的智能共享车位管理系统设计与开发[D]. 徐欣.浙江理工大学2019
  • [5].基因组序列CGR图形的小波多重分形分析及应用[D]. 韩佳静.复旦大学2008
  • [6].实物期权在房地产投资决策中的应用研究[D]. 宗江.西安建筑科技大学2008
  • [7].甘肃省邮政储蓄计算机网络应用软件统一版本工程建设方案[D]. 高桂萍.北京邮电大学2008
  • [8].可持续发展消费观浅论[D]. 刘宏鑫.吉林大学2007
  • [9].SVM几何修正法及其在DNA序列处理中的应用[D]. 郑捷.北京工业大学2001
  • [10].董事冲突利益交易的规制[D]. 黄芬.武汉大学2004
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自浙江理工大学的黄嘉禾,发表于刊物浙江理工大学2019-05-08论文,是一篇关于蛋白质序列论文,图形表示论文,广义迭代函数论文,神经网络论文,亚细胞定位论文,浙江理工大学2019-05-08论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自浙江理工大学2019-05-08论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  

    黄嘉禾:一类广义迭代图形表示在蛋白质序列分析中的应用论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢