龙蛇羊泉汤抗癌活性成分的虚拟筛选研究

论文摘要

中医药是我国数千年临床医学经验的结晶,它是基于系统生物学的多主分多靶点天然药物。中药中的生物活性分子是中药作用的基础。运用计算机辅助药物设计方法研究中药中的活性分子作用的机理,对于基于中药的多主分多靶点药物的开发,对于中药作用机理的阐述,对于中药的现代化都有重要的意义。在本文中,作者做了一些计算机辅助药物设计方法在龙蛇羊泉汤复方方剂中的应用。为了研究龙蛇羊泉汤这种传统中药处方的抗肿瘤活性,我们运用计算药理学方法着重对龙蛇羊泉汤中所含的187个分子进行了化学空间分析,对一些特征描述符的分布进行了阐述,同时采用主成分分析方法将多维化学空间映射到二维空间以得到更直观的图像,结果表明其中大部分化合物具有较好的类药性质。利用分子对接方法研究了187个化合物与12个肿瘤疾病相关的公认靶标的相互作用,以显示出龙蛇羊泉汤中分子在抗肿瘤方面多通路、潜在的协同作用的药理学性质。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 目录
• 第一章 前言
• 1.1 天然产物药物的研究概况
• 1.2 中医药研究概况
• 1.2.1 介绍
• 1.2.2 中医药抗癌研究概况
• 1.3 计算机辅助药物设计之构效关系
• 1.3.1 研究药物构效关系的目的
• 1.3.2 构效关系发展概况
• 1.3.3 构效关系的地位
• 1.4 计算机辅助药物设计之虚拟筛选
• 1.5 分子描述符和化学空间
• 第二章 复方龙蛇羊泉汤概述
• 2.1 龙蛇羊泉汤中药物组分介绍
• 2.1.1 龙葵
• 2.1.2 蛇莓
• 2.1.3 白英
• 2.1.4 灯芯草
• 2.1.5 海金沙
• 2.1.6 土茯苓
• 第三章 研究方法
• 3.1 研究对象
• 3.2 研究工具和方法
• 3.2.1 化合物结构库的构建
• 3.2.2 抗癌药物筛选靶标的选取
• 第四章 龙蛇羊泉汤主成分的化学空间分析
• 4.1 化学空间
• 4.2 描述符的计算
• 4.3 龙蛇羊泉汤组分分子与药物分子/类药分子主成分分析
• 第五章 龙蛇羊泉汤与抗肿瘤系统靶酶的相互作用研究
• 5.1 分子对接的计算方法
• 5.2 评价方法
• 5.3 对接结果分析与讨论
• 第六章 讨论
• 6.1 分子对接法在中药作用机制研究中的可行性
• 6.2 CADD模拟分析龙蛇羊泉汤的多靶点抑瘤机理
• 6.3 展望
• 致谢
• 参考文献
• 附录A
• 表A1 龙蛇羊泉汤中所含化合物及所属植物
• 表A2 龙蛇羊泉汤中所含药物成分分子结构
• 个人简历