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荷斯坦牛HSP70-1基因多态性与耐热性及乳腺炎抗性的关联分析

2020-12-07阅读(939)

荷斯坦牛HSP70-1基因多态性与耐热性及乳腺炎抗性的关联分析

论文摘要

热休克蛋白70（Heat shock proteins,HSP70）作为分子伴侣在正常和应激条件下对机体的生理机能发挥重要作用,它能参与细胞损伤的修复,异常聚集蛋白的解聚,对抗应激引起的细胞凋亡等,对机体耐受各种不良环境因素有重要的作用。本实验以HSP70-1基因为候选基因,在全基因的编码区寻找SNPs,并分析这些SNPs与荷斯坦牛耐热性及乳腺炎抗性的关系。一荷斯坦牛HSP70-1基因多态性与群体遗传特性根据NCBI登陆号为AY149618（19526bp）的HSP70-1基因序列设计九对引物并用PCR-SSCP、PCR-RFLP和CRS-RFLP相结合的方法寻找中国荷斯坦牛HSP70-1基因编码区的多态位点,结果发现1623bp处发生G-A-C的突变,2409bp处发生G-A的突变;两个突变位点匀为沉默突变,没有改变蛋白质的氨基酸序列。χ2检验结果表明两位点均未达到Hardy-Weinberg平衡。2409位点多态信息含量为0.276,属中度多态;1623位点为0.554,属高度多态,两位点多态信息含量较为丰富,具有作为分子标记的潜力。二荷斯坦牛HSP70-1基因多态性与耐热性的关联分析以直肠温度和红细胞钾离子浓度为荷斯坦牛的耐热指标,用SAS软件最小二乘分析一般线性模型分析山东地区三个现代化牛场的127头产奶牛HSP70-1基因型与耐热指标的相关性,结果表明2409处基因型与耐热指标相关性不显著,1623bp处基因型与红细胞钾离子浓度相关性不显著,而与热应激时期中国荷斯坦牛的直肠温度相关性显著（P<0.05）,GA基因型个体显著低于CC和GG基因型个体,GA基因型为耐热基因型。说明HSP70-1基因的1623位点可用作中国荷斯坦牛选育耐热牛群的分子遗传标记。三荷斯坦牛HSP70-1基因多态性与乳腺炎抗性的关联分析随机采取天津实验牛场的253个血样,这些样本有完整的DHI数据记录。其中SCC（Somaic Cell Count体细胞计数）被证明和乳腺炎的发生有很高的相关性。由SCC转化而来的SCS （Somatic Cell Score体细胞评分）因为数值符合正态分布,在统计应用中比SCC更有优势。采用SAS8.2软件对各实验牛群体的HSP70-1基因型与SCS的相关性进行分析,结合本实验实际建立最小二乘拟合线性模型,分析HSP70-1基因型、环境、胎次和季节等对SCS的影响;结果证明场次和胎次对SCS影响极显著（P<0.01）,产犊季节和1623位点基因型对SCS影响显著（P<0.05）,2409bp位点对SCS影响不显著（P>0.05）;1623bp位点不同基因型SCS差异显著,CC基因型明显低于GA、GG基因型,其它基因型之间差异不显著,CC基因型可初步判定为乳房炎抗性基因型;1623位点可以作为乳腺炎抗性育种的分子遗传标记。对某个数量性状进行定向的人工选择时,必然导致该数量性状的主基因以及与之相连锁的其它基因或遗传标记的遗传平衡被打破。本研究表明,在供试荷斯坦奶牛群体中HSP70-1基因座位处于极不平衡状态（P < 0. 01）,而1623座位基因型与荷斯坦奶牛的SCS和耐热性指标存在显著相关,说明奶牛在乳房炎抗性和耐热性方面受到选择的影响。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 中英文缩写对照表
  • 引言
  • 第一章 文献综述
  • 1 HSP70 研究进展
  • 2 HSP70 与奶牛热应激
  • 3 HSP70 与奶牛乳腺炎
  • 第二章 荷斯坦牛HSP70-1 基因多态性与群体遗传特性
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 实验方法
  • 1.3 数据处理
  • 2 结果与分析
  • 2.1 HSP70-1 基因PCR 扩增结果
  • 2.2 HSP70-1 基因编码区突变检测结果
  • 2.3 HSP70-1 基因在荷斯坦牛群中的群体遗传特性
  • 3 讨论
  • 3.1 几种 SNPs 检测方法的比较
  • 3.2 HSP70-1 基因座位的群体遗传特性
  • 4 结论
  • 第三章 荷斯坦牛HSP70-1 基因多态性与其耐热性的关系分析
  • 1 材料和方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 实验方法
  • 1.3 数据处理
  • 2 结果与分析
  • 3 讨论
  • 3.1 HSP70-1 基因多态性研究的意义
  • 3.2 直肠温度和红细胞钾浓度作为耐热性指标的可行性分析
  • 3.3 HSP70-1 基因与荷斯坦牛耐热性关系的分析
  • 4 结论
  • 第四章 荷斯坦牛HSP70-1 基因多态性与乳腺炎抗性的关联分析
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 实验方法
  • 1.3 数据处理
  • 2 结果与分析
  • 2.1 HSP70-1 基因多态性与群体SCS 的方差分析
  • 3 讨论
  • 3.1 奶牛抗乳房炎性状候选基因的研究
  • 3.2 HSP70-1 基因多态性与荷斯坦牛乳腺炎抗性的关系分析
  • 4 结论
  • 全文结论及创新点
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 导师评阅表

    • 相关论文文献

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