H1N1、H1N2亚型猪流感病毒的分离鉴定及H1N2分离株在猪体内分布规律的调查

H1N1、H1N2亚型猪流感病毒的分离鉴定及H1N2分离株在猪体内分布规律的调查

论文摘要

猪流感(Swine influenza,SI)是由猪流感病毒(swine influenza virus,SIV)感染猪群引起的一种猪的急性、传染性呼吸道疾病。SIV属正黏病毒科(Orthomyxoviridae)甲型流感病毒属(Influenzavirus A)及丙型流感病毒属(Influenzavirus C),目前在全世界猪群中流行的主要是甲型猪流感病毒。猪流感每年都对养猪业造成巨大的损失,同时作为重要的人畜共患病,其公共卫生学意义也十分重要。1.采集临床上出现呼吸道疾病症状的病死猪肺脏样品,接种SPF鸡胚,分离到1株病毒,命名为A/swine/Shanghai/1/2007(Sw/SH/1/2007)经鉴定Sw/SH/1/2007为H1N2亚型猪流感病毒。为进一步揭示该病毒遗传起源和分子特性,对病毒的8个基因片段进行了序列测定和遗传发生分析。结果显示,Sw/SH/1/2007的8个基因片段与2005-2006年分离自海南和广西的三株猪流感病毒相似性较高,遗传进化上同为北美三源重组H1N2亚型猪流感病毒,除M基因和NA基因外,其它的6个基因与最近爆发的猪源甲型H1N1人流感病毒有较高的同源性。与1999年分离自Indiana的北美三源重组H1N2亚型猪流感病毒标准毒株A/swine/Indiana/9K035/99相比,Sw/SH/1/2007的HAl蛋白有25个氨基酸的变异,其中有7个氨基酸发生在抗原位点,1个氨基酸的变异发生在受体结合位点上。由于276Asn→Ser的替换,Sw/SH/1/2007在276位丢失了一个潜在的糖基化位点;但同时由于274Asp→Asn的突变,在274位又出现了1个新的糖基化位点。我国2006年首次报道分离到3株北美三源重组型H1N2猪流感病毒,本次分离到的H1N2亚型猪流感病毒与这三株重组病毒亲缘关系较近,但与祁贤2004年报道的在浙江省分离的国内重组型H1N2亚型流感病毒具有较大的差异。这说明我国猪群中存在的H1N2亚型猪流感病毒来源较为复杂,既有人流感病毒和古典H1N1亚型猪流感病毒自然重配而产生的,同时也存在来源于北美的三源重组型H1N2猪流感病毒。2.从发生呼吸道疾病的某猪场中分离到一株病毒,经鉴定为H1N1亚型流感病毒。命名为A/Swine/Zhejiang/1/2007,简称Sw/ZJ/1/2007,对其8个基因片段进行全序列测定和遗传发生分析,核苷酸同源性分析结果表明,Sw/ZJ/1/2007的8个基因片段与禽源H1N1 SIV的相应基因同源性最高,其PB2.PB1.PA.HA. NP.NA.M和NS的核苷酸相似性为分别为96%、97%、97%、95%、97%、96%、98%和98%,表明Sw/ZJ/1/2007属于禽源H1N1 SIV,病毒没有基因重配现象发生。与6株禽源H1N1亚型猪流感病毒的氨基酸相似性为91.3-96.5%;与禽流感病毒Duck/Bavar ia/1/77相似性为88.3%。Sw/ZJ/1/2007的HA1蛋白序列与A/swine/Cotes d’Armor/1488/99相似性最高(96.5%),有14个氨基酸的差异,其中2个位于抗原位点Ca上。6个受体结合位点相对保守,只有134和222位存在变异。为了进一步揭示其遗传发生起源,绘制了Sw/ZJ/1/20078个基因片段的遗传进化树,结果表明Sw/ZJ/1/2007分离株与流行于欧洲的禽源H1N1 SIV属于同一亚系。此前中国大陆还未有该类猪流感病毒的报道,这提示我们近年来中国大陆地区猪流感的流行情况较为复杂。3. A/swine/Shanghai/1/2007(Sw/SH/1/2007)病毒1.84×104TCID50通过呼吸道途径人工感染60日龄仔猪,感染后间隔不同时间采取呼吸道粘膜样品、肛门拭子及内脏器官,采用荧光定量RT-PCR的方法检测病毒在仔猪体内的分布情况。结果,仔猪感染Sw/SH/1/2007后仅产生轻微的流感症状,并在两周后痊愈,整个流感病程约为2周,排毒持续时间1周。呼吸道粘膜、喉、气管在第3天即可检测到病毒,并持续到第10天;肺部淋巴结、脾脏在第5-7天检测到病毒;另外,除第5天采集的一头仔猪脑组织样品检测到病毒外,其它脏器均未检测到病毒,表明病毒的主要定殖组织为呼吸道系统以及脾脏。肛门拭子在感染后2-8天可持续检测到病毒核酸;鼻腔拭子在感染后即可检测到病毒,并在局部粘膜持续存在8天左右。结论:呼吸道粘膜是猪流感病毒的主要定殖场所,猪感染病毒以后,很快就可通过粪便向环境中排毒。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一篇 文献综述
  • 第一章 猪流感病毒的研究进展
  • 1 甲型流感病毒概述
  • 2 甲型流感病毒的编码基因和功能
  • 3 流感病毒的复制过程
  • 4 猪流感病毒的遗传变异
  • 5 SIV的流行情况
  • 6 SIV的致病性
  • 7 荧光定量PCR方法概述
  • 参考文献
  • 第二篇 试验研究
  • 第二章 一株基因重配H1N2亚型猪流感病毒的分离鉴定及分析
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 英文摘要
  • 第三章 H1N1亚型猪流感病毒遗传特性分析
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 英文摘要
  • 第四章 A/swine/Shanghai/1/2007病毒在猪体内的分布规律研究
  • 1 材料与方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 参考文献
  • 英文摘要
  • 全文总结
  • 附录
  • 致谢
  • 相关论文文献

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