绵羊Leptin基因SNPs多态性及其与生长发育性状的相关性分析

论文摘要

本研究是以典型群随机抽样方法采集3个国外引进品种（包括无角陶赛特121头、萨福克72头、得克塞尔73头）和国内品种滩羊89头。利用PCR-SSCP技术对这4个绵羊品种358个个体Leptin基因2、3外显子进行多态性分析,以及该基因与生长发育性状间的相关性研究;同时利用MEGA 4生物软件构建绵羊、山羊、水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡等物种间的系统发生树。结果如下:1.在Leptin基因外显子2上未发现突变;内含子2上存在A99G、G115A、C150T、C171T 4个SNP位点,G115A和C171T为两个新发现的多态位点;外显子3上检测到G271A、C316A、G387T 3个SNP位点;还新发现4种双突变类型,分别是A99G和C150T、A99G和G115A、A99G和C316A、A99G和G387T。C171T位点仅存在与无角陶赛特群体中,为无角陶赛特特有的SNP位点;C316A、A99G+G115A和A99G+C316A位点为得克塞尔群体特有的SNP位点;G387T和A99G+G387T位点仅存在于滩羊群体,为滩羊群体特有的品种特性。2.各SNP位点及双突变位点在各群体中突变频率都较低,在滩羊群体中检测到的SNPs比较丰富。得克塞尔群体A99G位点和滩羊群体G271A位点的基因型频率偏离Hardy-Weinberg平衡（P<0.01）,其他群体各位点基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。在A99G、C150T和A99G+C150T位点,不同品种之间基因型分布差异显著。3.绵羊外显子2、3共441 bp与山羊、水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡相应核苷酸序列同源性比较及ME、MP和NJ三种系统聚类方法构建的各物种间系统进化树结果一致:绵羊与山羊亲缘关系最近,遗传距离最小;而与水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡亲缘关系依次变远,同源性也依次降低,遗传距离亦随之增加。4.在影响生长发育性状指标的各因素中,品种效应占主导地位,品种与生长发育性状间存在极显著相关性（P<0.01）,性别对生长发育性状影响不显著（P>0.05）,各SNPs位点基因型对各生长发育性状指标影响不显著（P>0.05）。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 第一章 文献综述
• 1 Leptin 基因的研究进展
• 1.1 Leptin 基因的结构
• 1.2 Leptin 的生物学功能及作用机制
• 1.3 Leptin 在畜牧业上的应用前景
• 2 四个绵羊品种资源概况
• 3 PCR-SSCP 技术
• 4 遗传进化分析
• 5 研究目的和意义
• 第二章 绵羊Leptin 基因多态性检测及序列分析
• 1 材料与方法
• 1.1 试验动物
• 1.2 主要仪器与药品
• 1.3 试验方法
• 1.4 引物设计
• 1.5 目的片段检测
• 1.6 分析工具和软件
• 1.7 数据分析
• 2 结果与分析
• 2.1 SNPs 多态性检测
• 2.1.1 PCR 产物检测
• 2.1.2 SSCP 电泳结果分析
• 2.1.3 测序结果分析
• 2.1.4 遗传多态性指标的统计及基因型分布的χ2 检验
• 3 讨论
• 3.1 SNPs 分析
• 3.2 群体间基因型分布
• 第三章 绵羊Leptin 基因的遗传进化分析
• 1 材料与方法
• 1.1 试验材料
• 1.2 分析工具和软件
• 2 结果与分析
• 2.1 绵羊与其他物种间Leptin 基因编码区核苷酸序列比较分析
• 2.2 绵羊与其他物种间的系统进化分析
• 3 讨论
• 第四章 绵羊Leptin 基因SNPs 多态性与生长发育性状的相关分析
• 1 材料与方法
• 1.1 试验材料
• 1.2 分析工具和软件
• 1.3 数据分析
• 2 结果与分析
• 2.1 生长发育性状相关分析
• 3 讨论
• 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读硕士期间撰写或发表的论文