李魁鹏:杉木转录因子unigene中微卫星的分布论文

李魁鹏:杉木转录因子unigene中微卫星的分布论文

本文主要研究内容

作者李魁鹏,陈代喜,黄开勇,陈晓明,戴俊,陈琴(2019)在《杉木转录因子unigene中微卫星的分布》一文中研究指出:本研究以杉木转录组序列信息为基础,分析转录因子unigene中微卫星(transcription factor unigenederived microsatellites, TFUMs)的分布特征。结果表明,3 155个杉木转录因子(transcription factor, TFs) unigene中,存在527个TFUMs,25种基元。其中三、四核苷酸基元的类型最多,分别有10种和7种。由三、二核苷酸基元组成的TFUMs数目最多,分别为386和92个。AG/CT、AGC/CTG基元在TFUMs中分布最广,分别占二、三核苷酸重复TFUMs总数的53%和22%。根据基元的重复次数,杉木TFUMs主要可分为2个区间,重复5~8次的TFUMs分为第一区间,重复9~12次的分为第二区间。杉木TFUMs主要分布在第一区间,随着重复次数的增加,TFUMs数量呈现下降趋势。本研究首次运用卡方检验分析EST-SSRs在TFs及其余unigene中的分布差异,发现EST-SSRs特别是三核苷酸重复的EST-SSRs在TFs unigene中极显著富集。该研究为杉木TFUMs标记的开发与利用建立了基础。

Abstract

ben yan jiu yi sha mu zhuai lu zu xu lie xin xi wei ji chu ,fen xi zhuai lu yin zi unigenezhong wei wei xing (transcription factor unigenederived microsatellites, TFUMs)de fen bu te zheng 。jie guo biao ming ,3 155ge sha mu zhuai lu yin zi (transcription factor, TFs) unigenezhong ,cun zai 527ge TFUMs,25chong ji yuan 。ji zhong san 、si he gan suan ji yuan de lei xing zui duo ,fen bie you 10chong he 7chong 。you san 、er he gan suan ji yuan zu cheng de TFUMsshu mu zui duo ,fen bie wei 386he 92ge 。AG/CT、AGC/CTGji yuan zai TFUMszhong fen bu zui an ,fen bie zhan er 、san he gan suan chong fu TFUMszong shu de 53%he 22%。gen ju ji yuan de chong fu ci shu ,sha mu TFUMszhu yao ke fen wei 2ge ou jian ,chong fu 5~8ci de TFUMsfen wei di yi ou jian ,chong fu 9~12ci de fen wei di er ou jian 。sha mu TFUMszhu yao fen bu zai di yi ou jian ,sui zhao chong fu ci shu de zeng jia ,TFUMsshu liang cheng xian xia jiang qu shi 。ben yan jiu shou ci yun yong ka fang jian yan fen xi EST-SSRszai TFsji ji yu unigenezhong de fen bu cha yi ,fa xian EST-SSRste bie shi san he gan suan chong fu de EST-SSRszai TFs unigenezhong ji xian zhe fu ji 。gai yan jiu wei sha mu TFUMsbiao ji de kai fa yu li yong jian li le ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的李魁鹏,陈代喜,黄开勇,陈晓明,戴俊,陈琴,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年03期论文,是一篇关于杉木论文,转录因子论文,卡方检验论文,基因组学与应用生物学2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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