论文题目: 液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立及其在正常人尿蛋白质组鉴定中的应用
论文类型: 博士论文
论文专业: 病理生理学
作者: 孙伟
导师: 高友鹤
关键词: 蛋白质鉴定,反相液相色谱,电喷雾质谱,丰度抑制,电喷雾离子阱质谱,算法,筛选方法,筛选方法,两个或多个多肽筛选方法,手工验证,人尿蛋白质组,液相色谱,电泳,重复率
文献来源: 中国协和医科大学
发表年度: 2005
论文摘要: 本文对应用液质联用方法分离鉴定蛋白质组的多肽洗脱条件及鉴定的多肽性质进行了系统的分析研究。利用牛血清白蛋白酶切后产生的多肽混合物，应用反相液相色谱和电喷雾离子阱质谱联用的方法进行鉴定，确定多肽适宜的色谱洗脱条件，用马细胞色素C的酶切肽段对洗脱条件进行进一步验证，并确定液质联用方法的灵敏度。同时，本文对被鉴定的多肽性质进行了系统的分析。本实验表明胰酶酶切多肽的适宜乙腈洗脱梯度为5—30％，应用液质联用方法其鉴定灵敏度可以达到50fmol。对相应多肽性质分析表明，较长(长度在10个氨基酸以上)及带两个正电荷的多肽更易于被鉴定。本研究中所鉴定的多肽呈现出三种类型的重复鉴定即冗余性，(1)鉴定冗余：一种电荷状态的一个多肽被重复鉴定；(2)电荷冗余：几种电荷状态的同一多肽被重复鉴定；(3)序列冗余：由同一多肽产生序列上差一个或几个氨基酸的多个多肽重复鉴定。
论文目录:
序言
第一部分 液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立
第一章 应用液质联用方法鉴定蛋白质
前言
材料与方法
结果与讨论
结论
参考文献
第二章 蛋白质组鉴定中蛋白质丰度抑制的研究
前言
材料与方法
结果
讨论
结论
参考文献
第二部分 蛋白质组数据库检索结果分析方法的评价及其改进
第三章 评价SEQUEST检索结果筛选参数—Xcorr和Unified Score
前言
材料与方法
结果
讨论
结论
参考文献
第四章 应用手工验证规则自动验证SEQUEST检索结果质量
前言
材料与方法
结果
讨论
结论
参考文献
第三部分 蛋白质组学技术的应用
第五章 应用三种分离方法对尿蛋白质组进行分析
前言
材料与方法
结果和讨论
结论
参考文献
文献综述 蛋白质组学研究进展
在读期间发表文章
在读期间参加会议
致谢
附录
发布时间: 2006-10-13
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标签：蛋白质鉴定论文; 反相液相色谱论文; 电喷雾质谱论文; 丰度抑制论文; 电喷雾离子阱质谱论文; 算法论文; 筛选方法论文; 两个或多个多肽筛选方法论文; 手工验证论文; 人尿蛋白质组论文; 液相色谱论文; 电泳论文; 重复率论文;