扁蓿豆AFLP体系的建立及在其遗传完整性检测中的应用
论文摘要
AFLP(Amplified fragment length polymorphism)是一种新型的分子标记技术,目前已广泛应用于生物遗传多样性研究、种质资源鉴定及动植物育种等领域的研究。本试验建立了适合扁蓿豆的AFLP分析体系,并首次使用AFLP分子标记对扁蓿豆(Medicago ruthenica L.)种质的遗传完整性进行检测。以期为扁蓿豆种质资源保存、扁蓿豆分子遗传图谱的构建提供理论依据。主要研究结果如下:1.建立了适合扁蓿豆的AFLP分析体系。具体内容为:模板DNA的用量范围为100ng-600ng;酶切体系中,EcoRⅠ和MseⅠ各加入3U,在37℃下酶切反应4h;加入接头后在16℃连接10-12h;预扩增体系总体积为20μl,酶切连接产物为4μl;将预扩增体系稀释20倍后用于选择性扩增。2.从64个EcoRⅠ和MseⅠ引物组合中筛选出8对条带清晰,多态性高的引物, 8对引物共扩增出92个位点,其中多态性位点41个,占总位点数的44.57%,每个引物组合扩增的位点数在9-14个之间。3.各个老化处理群体的AFLP分析结果显示:人工老化对扁蓿豆种子的生活力虽然产生极显著影响,但对其种质的遗传完整性变化却未产生显著影响。此表明扁蓿豆种质具有较强的遗传稳定性。
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摘要Abstract1 前言1.1 文献综述1.1.1 分子标记概述1.1.2 AFLP 分子标记1.1.3 种质遗传完整性研究进展1.2 研究目的及意义2 扁蓿豆 AFLP 分析体系的探索及建立2.1 材料2.1.1 供试材料2.1.2 试剂2.2 方法2.2.1 扁蓿豆基因组 DNA 的提取2.2.2 模板 DNA 浓度和纯度检测2.2.3 AFLP 分析体系的探索2.2.4 引物筛选2.2.5 电泳结果处理2.3 结果与分析2.3.1 模板 DNA 的质量2.3.2 扁蓿豆 AFLP 分析体系的建立2.3.3 引物筛选的结果3 AFLP 分析人工老化处理对扁蓿豆遗传完整性的影响3.1 材料3.2 方法3.2.1 种子人工老化处理3.2.2 室内发芽率测定3.2.3 盆栽试验3.2.4 基因组 DNA 提取及质量检测3.2.5 AFLP 分析3.2.6 聚丙烯酰胺凝胶电泳3.2.7 数据统计与分析3.3 结果与分析3.3.1 人工老化处理对扁蓿豆种子发芽的影响3.3.2 8 对引物的AFLP 扩增结果3.3.3 不同老化处理群体等位基因频率分析3.3.4 不同老化处理群体遗传多样性分析3.3.5 不同老化处理群体遗传相似性分析4 讨论4.1 扁蓿豆AFLP 分析体系建立的关键因素4.1.1 基因组 DNA 的提取及质量4.1.2 酶切连接4.1.3 预扩增与选择性扩增4.1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳4.2 使用AFLP 检测扁蓿豆种质遗传完整性变化4.2.1 扁蓿豆种质遗传稳定性分析4.2.2 扁蓿豆种质更新发芽率分析4.2.3 扁蓿豆种质耐贮性分析4.2.4 展望5 结论致谢参考文献作者简介
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