PRL基因SNP与公鹅繁殖性状相关性的研究

论文摘要

动物垂体前叶分泌的催乳素（Prolactin，PRL）具有广泛的生物学效应，在家禽中PRL主要涉及到其繁殖性能。本研究采用PCR-SSCP和测序的方法检测了吉林白鹅肉用品系公鹅不同基因片段的多态性，对单核苷酸多态性进行了群体遗传学分析，探索不同基因型与公鹅繁殖性状之间的关系。本实验设计了7对引物，PCR-SSCP结果表明，在两对引物P3，P6中检测到单核苷酸多态位点，表现6种基因型（AA、BB、AB、CC、CD、DD），其中第一对引物基因中，A等位基因频率为0.3500，B等位基因频率为0.6500；第六对引物基因中，C等位基因频率为0.3905，D等位基因频率为0.6904：卡方检验表明P3，P6引物位点群体基因型分布之间差异不显著（P＞0.05），均处于Hardy-Weinberg平衡状态。测序结果表明，在外显子2存在一个C／T的单基因突变，第5外显子存在一个T／C的突变结果。相关性统计分析结果表明：P3引物AA基因型与吉林白鹅公鹅精液量和精液密度呈负相关，AB、BB基因型与密度呈正相关。P6引物中DD基因型与活力负相关，CC、CD基因型与活力呈正相关。组合基因型中，可以初步认为组合基因型AA／CC、AB／CD与活力呈正相关，BB／DD与活力呈负相关；组合基因型BB／CC、AB／CD、BB／CD与密度呈正相关，AA／CD与精液量负相关；组合基因型AA／CD与畸形率正相关，AB／CC与畸形率负相关。综合分析结果，初步认为可利用催乳素基因对吉林白鹅公鹅的繁殖性状进行标记辅助选择，以降低成本、提高选择进程和育种速度。

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文献综述

1 催乳素（PRL）的研究进展

1.1 催乳素的结构

1.2 PRL多态性研究

1.3 PRL的作用机理

1.4 催乳素的分泌调控

1.5 PRL的功能研究

2 候选基因法

2.1 SNP检测的主要方法

2.2 生物信息学方法

2.3 直接测序

2.4 单链构象多态性

2.5 基于PCR或酶切的方法

2.6 基因芯片技术

3 单链构象基因多态性的检测方法—PCR-SSCP

3.1 PCR-SSCP方法的建立与发展

3.2 PCR-SSCP方法的原理

3.3 PCR-SSCP方法的特点

3.4 PCR-SSCP技术在家禽上的研究进展

引言

材料与方法

1 试验材料

1.1 试验鹅的选择

1.2 试验器材

1.3 主要试剂及配制

2 试验方法

2.1 现场部分

2.2 试验室部分

3 统计分析方法

3.1 基因频率和基因型频率的计算

结果与分析

1 基因组DNA提取结果

2 引物筛选结果

3 SSCP检测结果

4 具有多态片段测序结果

5 基因频率和基因型频率的分析

6 PRL基因Hardy-Weinberg平衡检验

7 基因型与公鹅繁殖性能关联分析

8 PRL基因不同基因型组合与生产性能的相关

9 繁殖性能各性状间的相关系数

四讨论

1 SNP位点与公鹅繁殖性状相关分析

2 带型分析

结论

参考文献

附录A:吉林白鹅公鹅PRL基因引物P3 P6测序图

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致谢

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