非综合征性唇裂伴或不伴腭裂（nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate，NSCL／P）是一种比较常见的先天颜面部缺陷，亚洲和美洲发病率最高，目前多认为NSCL／P的发病与多基因遗传、环境及两者的相互作用相关。干扰素调节因子6（interferon regulatory factor 6，IRF6）和转化生长因子α（transforming growth factor-α，TGFA）是遗传因素中比较热点的基因。由于这两个基因与NSCL／P的关系不甚明了，故本研究旨在在非综合征性唇腭裂核心家庭中探讨IRF6、TGFA部分SNP位点与NSCL／P的关联性，试图确认这两个基因是否是本人群该疾病的易感基因，为日后筛选高危人群提供理论依据，同时评估基因芯片作为SNP方法的可行性。材料和方法：研究对象为来自江苏省人民医院和东南大学中大医院83位经整形外科医师确诊的非综合征性唇腭裂患者，年龄分布：5个月至30岁，均为华东地区散发型病例。部分患者的父亲和（或）母亲参与了此研究。本研究对这批患者及其父母DNA的IRF6、TGFA部分单核苷酸多态性（SNP）位点进行PCR特异性扩增，采用东南大学生物电子学国家重点实验室的基因芯片技术对所有PCR扩增产物进行SNP位点多态性检测，确定各成员各位点基因型。对各位点随机抽取部分样本的PCR产物直接测序。对芯片所得数据进行Hardy-Weinberg平衡检验，比较患者组和父母组的各位点基因型和等位基因分布，并拟予以单体型相对风险（HRR）分析和传递不平衡（TDT）检验。结果：由于HRR及TDT都需要采用核心家庭（患者及其父母）的基因型数据，故只有父亲或母亲基因型数据的家庭未纳入统计系统。本研究共有50个NSCL／P核心家庭。各SNP位点所有人群均可扩增。直接测序的PCR产物分型结果与芯片完全相同。患者组和父母组之间各位点基因型和等位基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05），两组的基因型等位基因分布均无明显差异。IRF6的V274I这个位点与NSCL／P相关联（HRR：x2=4.5816，P＜0.05，TDT：x2=4.787，P＜0.05）。该基因另一个位点rs2235375两种检验均阴性。TGFA两个SNP位点（C3827T、T3851C）HRR阳性（均有P＜0.05）而TDT阴性（均有P＞0.05）。讨论：根据本研究的结果，可以认为中国汉族人群中IRF6的V274I这个位点与NSCL／P易感基因存在连锁不平衡，IRF6可能是NSCL／P的易感基因之一，TGFA与NSCL/P的关系有待进一步研究。同时可以说明基因芯片是检测基因多态性的有效方法。本研究为候选基因IRF6与疾病相关的理论提供了有力证据，证明遗传因素在非综合征性唇腭裂发病中确实起了作用，能解释部分患者的发病机理，将来可筛选高危人群，减少患儿出生，提高优生优育水平。
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